Moore, J.: Oxford Academic Vocabulary Practice. OUP, 2017.
Kolaříková, Z., Petruňová, H., Timková, R.: Angličtina v akademickom prostredí – cvičebnica. Košice, Vydavateľstvo ŠafárikPress, 2021.
Tomaščíková, S., Rozenfeld, J. Developing Academic English in Speaking and Writing. Vydavateľstvo ŠafárikPress, 2021.
McCarthy, M., O´Dell, F.: Academic Vocabulary in Use. CUP, 2008.
Štepánek, L., J. De Haff a kol.: Academic English-Akademická angličtina. Grada Publishing, a.s., 2011.
Armer, T.: Cambridge English for Scientists. CUP, 2011.
lms.upjs.sk
Absolvovanie e-kurzu Anglický jazyk pre doktorandov (lms.upjs.sk), konzultácie (1-3).
Písomné zadania - Profesijný/akademický štruktúrovaný životopis, krátky akademický životopis
anglický jazyk B2 podľa SERR
Špecifiká akademického a odborného jazyka so zameraním na správnu výslovnosť, na rozvoj slovnej zásoby (menné a slovesné kolokácie, frázové slovesá, predložkové spojenia, slovotvorba, formálna/neformálna angličtina a i.), na vybrané gramatické aspekty (predložky, gramatické časy, trpný rod a i.), na akademické písanie (profesijný/akademický štruktúrovaný životopis a krátky akademický životopis).
Upevnenie jazykových zručností študentov - hovorenie, písanie, čítanie a počúvanie s porozumením. Zvýšenie jazykovej kompetencie študentov - študenti sa oboznámia s vybranými fonologickými, lexikálnymi a syntaktickými javmi. Rozvoj pragmatickej kompetencie študentov - študenti dokážu efektívne a účelovo komunikovať, na úrovni B2 podľa SERR so zameraním na akademickú angličtinu a odborný jazyk a terminológiu študijného odboru.
Prezentácia pracoviska doktoranda, jeho vlastného výskumu, vedecko-výskumných aktivít, naštudovanej odbornej literatúry a i.
Moore, J.: Oxford Academic Vocabulary Practice. OUP, 2017.
Kolaříková, Z., Petruňová, H., Timková, R.: Angličtina v akademickom prostredí (cvičebnica). UPJŠ Košice, 2021.
Tomaščíková, S., Rozenfeld, J. Developing Academic English in Speaking and Writing. Vydavateľstvo ŠafárikPress, 2021.
McCarthy, M., O´Dell, F.: Academic Vocabulary in Use. CUP, 2008.
Štepánek, L., J. De Haff a kol.: Academic English-Akademická angličtina. Grada Publishing, a.s., 2011.
Armer, T.: Cambridge English for Scientists. CUP, 2011.
Test, ústna skúška v súlade s požiadavkami na skúšku (dostupné na stránke CJP a v MS TEAMS)
anglický jazyk B2 podľa SERR
Komunikácia na akademickej pôde (sebaprezentácia, prezentovanie na odborných podujatiach, konferenciách a pod.).
Špecifiká akademického a odborného jazyka so zameraním na rozvoj slovnej zásob (formálne vyjadrovanie, akademický slovná zásoba), vybrané gramatické a syntaktické aspekty (trpný rod, nominalizácia), vybrané funkcie jazyka (vyjadrenie názoru, príčiny/následku, argumentovanie, uvádzanie príkladu, popis grafu/tabuľky/schémy, apod.) Jazyková interferencia.
Upevnenie jazykových zručností študentov - hovorenie, písanie, čítanie a počúvanie s porozumením, zvýšenie jazykovej kompetencie študentov - študenti si osvoja vybrané fonologické, lexikálne a syntaktické vedomosti, rozvoj pragmatickej kompetencie študentov - študenti dokážu efektívne využívať jazyk na dosiahnutie konkrétneho účelu, na úrovni B2 podľa SERR so zameraním na akademickú angličtinu a odborný jazyk a terminológiu študijného odboru.
Cieľom predmetu je oboznámiť študentov s metódami získavania a analýzy biologických sekvencií s využitím či už PC a voľne dostupného programového vybavenia (BioEdit, Prophet, GeneDoc, RasMol, VNTI-Viewer, MAGA), ako aj s použitím programového vybavenie dostupného cez www sieť. Okrem základných informácií získajú študenti aj informácie o niektorých špecializovaných analýzach – molekulárnej taxonómii, fylogenetickej analýze a predpovedaní štruktúr biopolymérov.
The phylogenetic handbook, Salemi, M., Vandamme, A-M., Cambridge University Press, 2003, 485 s.
Bioinformatics: a practical guide to the analysis of genes and proteins, Baxevanis, AD; Francis Ouellette, BF. 4th edition, Wiley, 2020, 609 s.
Samostatná práca.
Samostatná práca na zadaniach počas semestra
Záverečná práca, skúška.
slovenský, anglický
slovak
Použitie PC a online web serverov pri analýze sekvencií. Voľne dostupné biologické databázy (PubMed, GenBank, SwissProt). Analýza nukeotidových sekvencií. Analýza proteínových sekvencií. Párové porovnania sekvencií – blast analýza. Porovnanie viacerých sekvencií – program clustal. Molekulárna taxonómia baktérií. Evolučné a fylogenetické analýzy. Predpovedanie sekundárnej a terciárnej štruktúry biopolymérov.
Študent získa informácia a praktické skúsenosti s metódami získavania a analýzy biologických sekvencií s využitím či už PC a voľne dostupného programového vybavenia (BioEdit, RasMol, VNTI-Viewer, MAGA), ako aj s použitím programového vybavenie dostupného cez www sieť.
Okrem základných informácií získajú študenti aj informácie o niektorých špecializovaných analýzach – molekulárnej taxonómii, fylogenetickej analýze a predpovedaní štruktúr biopolymérov.
Záverečná práca, skúška.
Goffinet B, Shaw A J (2008) Bryophyte Biology (2nd ed.). Cambridge University Press
p. 580, ISBN 9780521693226
Vanderpoorten A, Goffinet B. (2009) Introduction to bryophytes. Cambridge University Press p. 328 ISBN 9780521700733
1. Účasť na seminároch (aj v prípade on-line výučby) Študenti sú povinní sa zúčastňovať seminárov. Príslušný učiteľ, ktorý vedie seminár ospravedlní odôvodnenú neúčasť študenta (práceneschopnosť, rodinné dôvody a pod.) maximálne na dvoch seminároch počas semestra bez nutnosti náhradného plnenia. V prípade dlhodobejšej odôvodnenej neúčasti (napríklad z dôvodu práceneschopnosti), určí príslušný učiteľ študentovi náhradnú formu zvládnutia vymeškanej matérie;
2. Preukázanie vedomosti a znalosti z oblasti oddelenia machorastov získaných na prednáškach aj seminároch (systematika machorastov, distribučné, ekologické a fyiologické vlastnosti machorastov)
3. Preukázanie dostatočných zručností využívania metodík, ktoré sú súčasťou laboratórnych cvičení predmetu
4. Absolvovanie ústnej skúšky, kde absolvent preukáže dostatočné vedomosti v aplikačnej biológii machorastov
slovenský, anglický
1. Systematika machorastov
2. Nomenklatúra a fylogenetika
3. Chemizmus machorastov ( pečeňovky, rožteky)
4. Chemizmus machorastov (machy)
5. Funkčné znaky machorastov (pečeňovky, rožteky)
6. Funkčné znaky machorastov (machy)
7. Funkčné znaky machorastov (vzťahy k iným organizmom)
8. Ekológia machorastov (idioekológia)
9. Ekológia machorastov (cenológia)
10. Machorasty súvisiace s prostredím (prírodné prostredie)
11. Machorasty súvisiace s prostredím (umelé prostredie)
12. Biotechnológie machorastov (pečeňovky, rožteky)
13. Biotechnológie machorastov (machy)
Študent si osvojí základy druhej najväčšej skupiny suchozemských rastlín, nazývaných machorasty. Predmetom štúdia bude systematika, distribučné, ekologické a fyziologické vlastnosti a osobitosti skupiny. Okrem toho študent získa vedomosti o aplikačnej biológii machorastov, dôraz sa bude klásť na ekotechniku, environmentálne využitie a biotechnológiu. Cieľom predmetu je, aby študenti mali predstavu o fundamentálnom význame ako aj o význame tejto zanedbanej skupiny rastlín.
Van den Hoek, C. a kol. 1995: Algae, an introduction to phycology,
Deacon, J.W. 1997: Modern Mycology
Paracer S., Ahmadjian V., 2000: Symbiosis: an introduction to Biological Associations
1. prezentácia semestrálneho projektu na vybranú tému
2. preukázanie vedomosti z predmetu ústnou formou
slovenský, anglický
1.Úvod do štúdia symbióz
2.Vírusy a ich symbióza s hubami, riasami a rastlinami
3.Bakteriálne asociácie s rastlinami
4.Hubové asociácie s hubami, riasami a rastlinami
5.Asociácie rias s protozoa a bezstavovcami
6.Symbióza kvitnúcich rastlín
7.Symbióza korálových útesov
8.Endosymbióza
9.Morfologické, cytologické, fyziologické a biochemické aspekty najznámejších príkladov
rastlinných symbióz.
10.signály a komunikácia v symbióze rastlín (signalizácia siníc s rastlinami)
11.Signály a komunikácia v symbióze rastlín (signalizácia ektomykoríznych symbióz)
12. Ekologické využitie rastlinných symbióz v praxi
13.prezentácia semestrálneho projektu
Po absolvovaní predmetu študent získa vedomosti a znalosti o tom čo je to symbióza, aká je jej úloha a význam so zameraním na interakcie v rastlinnej ríši. Študent by mal vedieť aplikovať získané vedomosti v praxi ako napríklad pri pestovaní plodín či v záhradníctve. Taktiež by mal vedieť využiť vedomosti získané absolvovaním tohto predmetu pri realizácii experimentov, ktoré sa týkajú symbióz.
Získaná citácia v domácom vedeckom časopise.
Získanie citácie preukazuje široké a veľmi dobre podložené vedecké poznanie v skúmanej oblasti, založené na spôsobilosti formulovať výskumné otázky, reflektovať vedecký problém takým spôsobom, ktorý generuje nové poznanie. Zároveň citácia v indexovanom zdroji preukazuje kompetentnosti komunikovať nové poznanie, ktoré je významným príspevkom k vedeckému poznaniu, na významnej expertnej úrovni.
Získaná citácia registrovaná v SCI alebo Scopus
Získanie citácie preukazuje široké a veľmi dobre podložené vedecké poznanie v skúmanej oblasti, založené na spôsobilosti formulovať výskumné otázky, reflektovať vedecký problém takým spôsobom, ktorý generuje nové poznanie. Zároveň citácia v indexovanom zdroji preukazuje kompetentnosti komunikovať nové poznanie, ktoré je významným príspevkom k vedeckému poznaniu, na najvyššej expertnej úrovni
Absolvovanie certifikovaného odborného kurz.
Doktorand získava aktuálne vedecké poznatky, rozvíja spôsobilosti vedeckej práce a oboznamuje sa s metodikami sprístupňovania vedeckých poznatkov. Konfrontuje vlastné vedomosti a zručnosti s ostatnými účastníkmi kurzu, rozvíja spôsobilosti rovesníckej diskusie v danom vednom odbore.
Získaná citácia v zahraničnom vedeckom časopise.
Získanie citácie preukazuje široké a veľmi dobre podložené vedecké poznanie v skúmanej oblasti, založené na spôsobilosti formulovať výskumné otázky, reflektovať vedecký problém takým spôsobom, ktorý generuje nové poznanie. Zároveň citácia v indexovanom zdroji preukazuje kompetentnosti komunikovať nové poznanie, ktoré je významným príspevkom k vedeckému poznaniu, na najvyššej expertnej úrovni.
Aktívna účasť na domácej konferencii.
Aktívnou účasťou na domácej vedeckej konferencii doktorand preukazuje vysokú mieru spôsobilosti identifikovať, vyhodnotiť, aplikovať správne vedecké metódy alebo metodiku výskumu vo svojom vednom odbore. Demonštruje spôsobilosť reflektovať konkrétny vedecký problém využitím najnovších prístupov a ich kritickým aplikovaním. Preukazuje kompetentnosť inovatívnym spôsobom využívať jestvujúce teórie a koncepty, ako aj generovať nové originálne vedecké poznanie a komunikovať výsledky výskumu širšiemu publiku adekvátnymi prostriedkami a prostredníctvom slovenského jazyka
Aktívna účasť na domácej konferencii so zahraničnou účasťou.
Aktívnou účasťou na vedeckej konferencii doktorand preukazuje vysokú mieru spôsobilosti identifikovať, vyhodnotiť, aplikovať správne vedecké metódy alebo metodiku výskumu vo svojom vednom odbore. Demonštruje spôsobilosť reflektovať konkrétny vedecký problém využitím najnovších prístupov a ich kritickým aplikovaním. Preukazuje kompetentnosť inovatívnym spôsobom využívať jestvujúce teórie a koncepty, ako aj generovať nové originálne vedecké poznanie a komunikovať výsledky výskumu širšiemu publiku adekvátnymi prostriedkami a prostredníctvom slovenského alebo cudzieho jazyka.
Forma výučby: priama výučba, individuálne konzultácie, praktické činnosti, samoštúdium.
Odporúčaný rozsah výučby ( v hodinách ):
Za obdobie štúdia: 14 – priama výučba, 14 – individuálne konzultácie, 56 – praktické činnosti, 56 – samoštúdium.
Metóda štúdia: prezenčná, dištančná.
Murphy A.S. et al. The plant plasma membrane. Springer-Verlag Berlin Heidelberg 2011; Taiz L.et al. Plant Physiology and Development. Sixth editon. Sinauer ass.,Sunderland 2014; Bhatla S.C., Lal M.A. Plant Physiology, development and metabolism. Springer Nature Singapore Pte Ltd. 2018;
Články vo vedeckých časopisoch.
1. Vypracovanie jednej semestrálnej práce na vopred zadanú tému.
2. Skúška predmetu prebieha ústnou formou na náhodne vybranú otázku. Študent prednesie tému svojej semestrálnej práce a následne prebehne diskusia s vyučujúcim na danú tému.
slovenský, anglický
Priama výučba (“prednášky”) a praktické činnosti (“cvičenia”) sú zamerané na rozšírenie poznatkov a praktických zručnosti zo 14 tém:
1. Metabolizmus a metabolóm, proteóm a transkriptóm v cievnatých rastlinách a využitie v ekofyziológii rastlín.
2. Metabolizmus a metabolóm, proteóm a transkriptóm, ich špecifiká v bezcievnatých rastlinách a využitie v ekofyziológii rastlín.
3. Ekofyziologické vzťahy medzi rastlinami navzájom a s inými organizmami.
4. Komunikácia rastlín v prostredí.
5. Ekofyziologické aspekty adaptácie rastlín.
6. Adaptívna evolúcia.
7. Interakcie mikroevolučných a ekofyziologických faktorov v rastlinných adaptáciach.
8. Ekofyziologické aspekty minerálnej výživy rastlín.
9. Prerozdeľovanie a alokácia biomasy v rastlinách vo vzťahu k prostrediu.
10. Modifikácia rizosféry rastlinami.
11. Fyziologické faktory ovplyvňujúce efektívne využitie vody rastlinou.
12. Reprodukčná biológia, embryológia a produktivita rastlín z pohľadu ekofyziológie.
13. Adaptačné mechanizmy rastlín na klimatické zmeny.
14. Nové poznatky z ekofyziológie rastlín, vybrané témy z najnovších publikácií z odboru.
Praktické činnosti budú organizované v blokoch a budú zamerané na demonštráciu a osvojenie si vybraných techník študentami – vybrané fenotypizačné techniky, hodnotenie antioxidačných enzymatických systémov, využitie prietokovej cytometrie pri stanovení niektorých fyziologických parametrov, modifikácie metód hodnotenia fyziologických parametrov pre efektívny skríning veľkého počtu vzoriek, techniky pre štúdium stratégii rastlín pre detoxifikáciu, techniky cytogenetickej transformácie rastlín, produkcia izogenetických dihaploidných línii rastlín.
Individuálne konzultácie a samoštúdium:
keďže vybrané témy z ekofyziológie rastlín pre priamu výučbu sú obšírne a zamerané ako na bezcievnaté a aj cievnaté rastliny, viaceré odporúčané kapitoly budú podľa potrieb a zamerania dizertačných prác študentov určené na samostatné štúdium študentami a konzultáciu s vyučujúcimi.
Aktualizácia, rozšírenie a upevnenie poznatkov o mechanizmoch ekofyziologických procesov
v rastlinách. Pochopenie vzťahov a interakcií medzi rastlinami navzájom a prostredím. Študenti by mali byť schopní realizovať a koordinovať predovšetkým laboratórne, ale aj terénne ekofyziologické výskumné úlohy.
Zborník príspevkov z Jarnej školy doktorandov vydaný na záver podujatia.
Aktívna účasť na Jarnej škole doktorandov. Prezentácia výsledkov vlastnej vedeckej práce alebo vedeckého projektu doktorandského štúdia.
slovenský, anglický
1. Interdisciplinárne prednášky z odborov medicína, prírodné vedy,právo, verejná sráva, humanitné vedy. Prednášatelia - špičkoví zahraniční alebo domáci odborníci z uvedených odboroch.
2. Vedecké prednášky v sekciách vytvorených rámci príbuzných odborov. Prednášatelia - špičkoví odborníci z UPJŠ z uvedených odborov.
3. Vedecké príspevky doktorandov v sekciách príbuzných odborov.
4. Panelové diskusie k problematike doktorandského štúdia a k aktuálnym trendom rozvoja vedných disciplín na UPJŠ.
1. Interdisciplinárne prednášky z odborov medicína, prírodné vedy,právo, verejná sráva, humanitné vedy. Prednášatelia - špičkoví zahraniční alebo domáci odborníci z uvedených odboroch.
2. Vedecké prednášky v sekciách vytvorených rámci príbuzných odborov. Prednášatelia - špičkoví odborníci z UPJŠ z uvedených odborov.
3. Vedecké príspevky doktorandov v sekciách príbuzných odborov.
4. Panelové diskusie k problematike doktorandského štúdia a k aktuálnym trendom rozvoja vedných disciplín na UPJŠ.
100/0
Získanie vedomostí o aktuálnych trendoch rozvoja vedných disciplín na UPJŠ v domácom i medzinárodnom kontexte. Prezentácia vlastných vedeckých výsledkov alebo vedeckého projektu doktorandského štúdia v komunite doktorandov vlastného odboru i príbuzných vedných odborov.
Konzultant záverečnej práce.
Konzultovaním záverečnej práce doktorand preukazuje široké a vedecky podložené poznanie v študijnom odbore, ako aj poznanie širokého spektra metód a prístupov. Preukazuje spôsobilosť kriticky posúdiť odborný problém a jeho navrhované riešenie, ako aj vyhodnotiť ho a prípadne navrhnúť iné riešenie. Aplikuje poznatky a spôsobilosti z oblasti pedagogických vied do vlastného odboru.
Briggs: Plant Microevolution and Conservation in Human-influenced Ecosystems (2009)
Wendel J.F.: Plant Genome Diversity, Vol. 1 (2014)
Briggs a Walters: Plant variation and evolution (2016)
Szulkin et al.: Urban Evolutionary Biology (2020)
Templeton: Population Genetics and Microevolutionary Theory (2021)
1. Aktívna účasť na praktických cvičeniach.
2. Podminekou absolvovania predmetu je aj vypracovanie semestrálnej práce na tému vopred dohodnutú s vyučujúcim.
3. Skúška predmetu prebieha ústnou formou.
Akékoľvek zmeny alebo modifikácie podmienok na absolvovanie predmetu vplyvom pandémie COVID19, alebo iných závažných dôvodov sú priebežne uverejňované na elektronickej nástenke predmetu.
slovenský, anglický
slovak, english
1. Biologická evolúcia. Prirodzený a pohlavný výber. Dedičnosť. Mutácie. Speciácia a fylogenetika. Makro- a mikro-evolúcia rastlín. Speciačné gény. Prehľad evolučných procesov v riasach, hubách, machorastoch, výtrusných a semenných cievnatých rastlinách. Evolučné ťahy.
2. Populácia, štruktúra populácií, genetický tok. Štúdium populačnej histórie, identifikácia genetických línii a ich genetická, morfologická a priestorová diferenciácia vo vzťahu k evolučnej histórii druhu a biologickým procesom.
3. Rastlinný jadrový genóm. Veľkosť genómu, fenotyp. Transpozóny. Genome obesity, genome downsizing.
4. Cytogenetika, akcesorické chromozómy a mikroevolúcia. Genomické prestavby doprevádzajúce mikroevolučné procesy.
5. Ekologické zmeny a mikroevolučné odpovede rastlín. Evolúcia ekologickej niky rastlín. Invázne rastliny a ich interakcia s pôvodnými druhmi. Kriticky ohrozené rastlinné druhy. Mikroevolúcia rastlín v stresujúcom prostredí.
6. Evolučné trendy rastlín, hybridizácia a polyploidizácia. Základné termíny, homoploidné hybridy, auto- a alo-polyploidizácia. Prirodzený a antropicky ovplyvnený vznik polyploidov. Mikroevolúcia v antropocéne.
7. Polyploidizácia a mikroevolúcia populácií. Cytotypovo čisté a zmiešané populácie, primárna a sekundárna kontaktná zóna cytotypovo odlišných subpopulácií. Cytotypovo odlíšne druhy. „Triploid block“ a „triploid bridge“. Reprodukčná izolácia. Princíp „minority cytotype exclusion“.
8. Multiplikácia genómu a mikroevolučné procesy vo fyziológii rastlín. Transkriptomické, proteomické a metabolomické vzory v príkladoch.
9. Reprodukčná ekológia. Interakcia sexuálne a asexuálne sa rozmnožujúcich jedincov. Interakcia peľových zŕn, „mentor effect“. Apomeióza, pseudogamia a mikroevolučný vplyv na populácie a druhy.
10. Vznik reprodukčno-izolačných bariér. Prezygotické a postzygotické bariéry. Vzťah opeľovač-rastlina. Koevolučné vzorce v mikroevolúcii rastlín. Efekt zakladateľa, genetický drift a adaptívna radiácia.
11. Mikroevolúcia v agrárnej krajine I. Vzájomné interakcie medzi divorastúcimi rastlinami a ich kultúrnymi, pestovanými, evolučne príbuznými plodinami.
12. Mikroevolúcia v agrárnej krajine II. Vzájomné interakcie medzi prostredím, živočíchmi a kultúrnymi, pestovanými plodinami. Posúdenie rizík obhospodárovanej krajiny na biodiverzitu a biodisparitu z mikroevolučného hľadiska.
13. Klimatické zmeny, polutanty, toxické látky v prostredí a vplyv na rastlinné spoločenstvá a rýchlosť evolúcie rastlín.
Po absolvovaní predmetu by mal študent pochopiť mikroevolučné procesy a vzorce adaptability rastlín ako odpoveď na rôzne faktory prostredia v modernej ére, v antropocéne. Dôraz je kladený na hybridizáciu a polyploidizáciu ako dve hlavné mikroevolučné procesy rastlín, a ich dôsledky v genetickej a cytotypovej štruktúre populácií. Hybridizácia a polyploidizácia vedú k náhlemu vzniku druhov, pritom sa uplatňujú rôzne procesy , ktoré ich vznik stabilizujú alebo narúšajú. Mikroevolúcia rastlín je urýchlená intenzívnou zmenou prostredia predovšetkým činnosťou človeka. Študenti sa oboznámia s dôsledkami klimatických zmien, znečisteného prostredia na mikroevolúciu rastlín v prírodnej a antropogénnej krajine.
Aktívna účasť na medzinárodnej konferencii v zahraničí.
Aktívnou účasťou na medzinárodnej vedeckej konferencii v zahraničí doktorand preukazuje vysokú mieru spôsobilosti identifikovať, vyhodnotiť, aplikovať správne vedecké metódy alebo metodiku výskumu vo svojom vednom odbore. Demonštruje spôsobilosť reflektovať konkrétny vedecký problém využitím najnovších prístupov a ich kritickým aplikovaním. Preukazuje kompetentnosť inovatívnym spôsobom využívať jestvujúce teórie a koncepty, ako aj generovať nové originálne vedecké poznanie a komunikovať výsledky výskumu širšiemu publiku adekvátnymi prostriedkami a prostredníctvom cudzieho jazyka.
Oboznámiť študentov s modernými molekulárnobiologickými technikami a ich využitím vo výskumnej oblasti a naučiť ich praktickým základom a zručnostiam molekulárnej biológie potrebným pre prax.
J. Reinders a A.Sickmann: Proteomics: Methods and Protocols (Methods in Molecular Biology), Humana Press, 2009
G. Ecker et al.: Transporters as Drug Carriers: Structure, Function, Substrates: 44 (Methods and Principles in Medicinal Chemistry), Wiley-VCH, 2009
J. Pawley: Handbook of Biological Confocal Microscopy, Springer, 2006
samostatná práca
samostatná práca
skúška
Práca v sterilných podmienkach v laboratóriu bunkových kultúr, kultivácia nádorových bunkových kultúr, metódy izolácie nukleových kyselín z buniek, stanovenie obsahu proteínov v bunkových lyzátoch, meranie enzymatických aktivít, techniky polymerázovej reťazovej reakcie, western blot, dot-blot, fluorescenčná mikroskopia, flowcytometrická analýza rozličných dejov v bunke (bunkový cyklus, bunková smrť, zmeny na úrovni mitochondrií, proteínov).
Oboznámiť študentov s modernými molekulárnobiologickými technikami a ich využitím vo výskumnej oblasti a naučiť ich praktickým základom a zručnostiam molekulárnej biológie potrebným pre prax.
skúška
Spoluautor monografie v renomovanom vydavateľstve.
Publikovaním monografia v renomovanom vydavateľstve doktorand preukazuje vysokú mieru spôsobilosti identifikovať, vyhodnotiť, aplikovať správne vedecké metódy alebo metodiku výskumu. Demonštruje spôsobilosť reflektovať vedecký problém využitím najnovších prístupov a ich kritickým aplikovaním. Preukazuje kompetentnosť inovatívnym spôsobom využívať jestvujúce teórie a koncepty, ako aj generovať nové originálne vedecké poznanie, ktoré dokáže publikovať podľa najvyšších kvalitatívnych a etických štandardov odboru. Doktorand preukazuje spôsobilosť kriticky vyhodnotiť a reagovať na podnety recenzentov, finalizovať vlastné myšlienky.
Spoluautor monografie.
Publikovaním monografia v renomovanom vydavateľstve doktorand preukazuje vysokú mieru spôsobilosti identifikovať, vyhodnotiť, aplikovať správne vedecké metódy alebo metodiku výskumu. Demonštruje spôsobilosť reflektovať vedecký problém využitím najnovších prístupov a ich kritickým aplikovaním. Preukazuje kompetentnosť inovatívnym spôsobom využívať jestvujúce teórie a koncepty, ako aj generovať nové originálne vedecké poznanie, ktoré dokáže publikovať podľa najvyšších kvalitatívnych a etických štandardov odboru. Doktorand preukazuje spôsobilosť kriticky vyhodnotiť a reagovať na podnety recenzentov, finalizovať vlastné myšlienky.
Forma výučby: priama výučba, individuálne konzultácie, praktické činnosti, samoštúdium.
Odporúčaný rozsah výučby ( v hodinách ):
Za obdobie štúdia: 14 – priama výučba, 28 – individuálne konzultácie, 14 – praktické činnosti, 28 – samoštúdium.
Metóda štúdia: prezenčná, dištančná.
Články vo vedeckých časopisoch.
Platné vnútorné predpisy UPJŠ k etike vedeckej práce: https://www.upjs.sk/informacie/vyskum/vedeckovyskumna-cinnost/etika/
Európsky kódex etiky a integrity výskumu, Revidované vydanie. Európska federácia akadémií vied ALLEA - All European Academies, Berlín 2018: https://www.upjs.sk/app/uploads/2022/09/ALLEA-European-Code-of-Conduct-for-Research-Integrity-2018-Slovak-dig.pdf
Podmienkou absolvovania predmetu je vypracovanie návrhu plánu pre postup spracovania časti dizertačnej práce z metodologického hľadiska.
slovenský, anglický
Priama výučba a praktické činnosti sú zamerané na rozšírenie poznatkov a praktických zručnosti zo 14 tém:
1. Dizertačná práca, definovanie výskumných úloh, náčrt publikačných výstupov.
2. Návrh výskumného projektu, grantové schémy pre študentov.
3. Kooperácia, čiastkové úlohy, harmonogram a spätná kontrola postupu prác výskumného projektu.
4. Etické štandardy vedeckej práce.
5. Formulácia hypotéz, experimentálne a observačné dáta.
6. Analýza metodologických aspektov prípravy dizertačnej práce.
7. Dizajn komplexných experimentov, návrh postupu laboratórnych a terénnych prác.
8. Analýza experimentálnych a observačných dát v biológii rastlín.
9. Pokročilé metódy vyhodnotenia komplexných dát a limity ich interpretácie.
10. Vizualizačné techniky komplexných dát.
11. Príprava publikácie, formálne aspekty publikačných výstupov.
12. Výber cieľového vedeckého periodika, nástroje pre cielený výber.
13. Spracovanie a prezentácia vedeckých výsledkov dizertačnej práce.
14. Proces publikovania vedeckej práce a recenzné konanie.
Praktické činnosti zahŕňajú riešenie praktických úloh, ktoré budú zamerané na rozvoj prezentácie výsledkov samostatnej práce študentov na témach ich dizertačných prác, a to v jednotlivých tématických oblastiach prezentovaných počas priamej výučby.
Individuálne konzultácie a samoštúdium:
vybrané témy budú odporúčané na samoštúdium a následnú konzultáciu s vyučujúcimi. Budú to predovšetkým tie témy, ktoré sú zamerané na vyhodnotenie, spracovanie a prezentáciu očakávaných observačných a experimentálnych dát študentov. Individuálne konzultácie sa budú týkať aj možnej prípravy grantových projektov študentov, resp. spracovania ich existujúcich čiastkových výsledkov v kontexte prezentovaných tém priamej výučby.
Absolvovaním predmetu Metodológia výskumu pre dizertačnú prácu študent získa aktuálne poznatky o metodických prístupoch pri riešení komplexných výskumných otázok vo fyziológii rastlín a nadobudne spôsobilosti pre spracovanie a prezentovanie vedeckých výsledkov práce v podobe karentovanej vedeckej publikácie.
Publikácia uverejnená v nerecenzovanom zahraničnom alebo domácom zborníku ako autor/spoluautor
Publikovaním v nerecenzovanom zahraničnom alebo domácom zborníku ako autor/spoluautor doktorand preukazuje spôsobilosť identifikovať, vyhodnotiť, aplikovať správne vedecké metódy alebo metodiku výskumu. Demonštruje spôsobilosť reflektovať vedecký problém využitím najnovších prístupov a ich kritickým aplikovaním. Preukazuje kompetentnosť inovatívnym spôsobom využívať jestvujúce teórie a koncepty, ako aj generovať nové originálne vedecké poznanie, ktoré dokáže publikovať podľa najvyšších kvalitatívnych a etických štandardov odboru. Doktorand preukazuje spôsobilosť finalizovať vlastné myšlienky v písomnom prejave.
Uvedená v schválenom zadaní dizertačnej práce.
Dizertačná práca je výsledkom vlastného vedeckého výskumu študenta. Nesmie vykazovať prvky akademického podvodu a musí spĺňať kritériá správnej výskumnej praxe definované v Rozhodnutí rektora č. 21/2021, ktorým sa stanovujú pravidlá posudzovania plagiátorstva na Univerzite Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach a jej súčastiach. Plnenie kritérií sa overuje najmä v procese školenia a v procese obhajoby práce. Ich nedodržanie je dôvodom na začatie disciplinárneho konania.
Študent realizuje činnosti pod vedením školiteľa dizertačnej práce. Výsledkom práce študenta má byť splnenie cieľov uvedených v schválenom zadaní dizertačnej práce.
Dizertačná práca má charakter vedeckej práce a študent ňou preukáže rozsiahle zvládnutie teórie a odbornej terminológie študijného odboru, nadobudnutie vedomostí, zručností a kompetentností v súlade s deklarovaným profilom absolventa študijného programu, ako aj schopnosť aplikovať ich originálnym spôsobom pri riešení vybraného vedeckého problému. Študent preukáže schopnosť samostatnej vedeckej práce z obsahového, formálneho a etického hľadiska. Ďalšie podrobnosti dizertačnej práce určuje Smernica č. 1 /2011 o základných náležitostiach záverečných prác a Študijný poriadok UPJŠ v Košiciach pre doktorandské štúdium.
Získanie požadovaného počtu kreditov v predpísanej skladbe podľa študijného poriadku UPJŠ, vypracovanie a obhajoba práce, úspešne vykonaná dizertačná skúška.
Doktorand preukázal predpoklady na úspešné pokračovanie v štúdiu splnením podmienok predpísaných študijným poriadkom pre študijnú a vedeckú časť doktorandského štúdia viažucu sa na tému dizertačnej práce.
Beránek, J. (2023). Moderní pedagogické metody a přístupy. Praha: Portál.
Fiala, M. (2023). Didaktika a metodika v současné škole. Praha: Grada Publishing.
Kováč, M. (2023). Vzdelávanie v 21. storočí: Inovatívne prístupy a metódy. Nitra: Vydavateľstvo UKF v Nitre.
Koudelka, J. (2023). Moderní didaktika a její aplikace. Praha: Karolinum.
Křížová, M., & Šebová, P. (2023). Vzdělávání učitelů: Teoretické a praktické přístupy. Praha: Triton.
Kučerová, M. (2023). Vzdělávání učitelů a profesionální rozvoj. Praha: Triton.
Mocová, M., & Lázňovská, M. (2023). Pedagogika a jej aplikácie v praxi. Bratislava: Vydavateľstvo Spolku slovenských pedagogických pracovníkov.
Novák, J., & Pol, M. (2024). Pedagogické výzkumy a inovace ve vzdělávání. Praha: Portál.
Sikora, J. (2022). Didaktika a metodika vzdelávania: Nové výzvy a trendy. Bratislava: Vydavateľstvo Univerzity Komenského v Bratislave.
Škoda, J. (2022). Efektivní výuka: Praktické strategie a metody. Praha: Grada Publishing.
Švec, J. (2023). Didaktika a školní politika: Teorie a praxe. Praha: Grada Publishing.
Vojtová, K. (2024). Diferenciace a inkluze ve vzdělávání. Praha: Wolters Kluwer.
1. Vypracovanie pedagogického denníka - 100%.
2. Povinná aktívna účasť a dochádzka v súlade so Študijným poriadkom.
slovenský
Osobnosť vysokoškolského učiteľa. Vyučovací štýl učiteľa. Študent vo vysokoškolskej výučbe. Učebné štýly študentov. Možnosti prispôsobenia vyučovacích štýlov učiteľa a učebných štýlov študentov. Interakcia a komunikácia vysokoškolský učiteľ – študent vo vyučovacom procese. Pedagogické kompetencie vysokoškolského učiteľa. Didaktická analýza učiva, učebný text, učebnica. Formy vysokoškolskej výučby. Metódy vysokoškolskej výučby. Metódy preverovania a hodnotenia študentov. Tvorba didaktického testu. Projektovanie vyučovacieho procesu vysokoškolského učiteľa. Sebareflexia vysokoškolského učiteľa.
Študent/ka po absolvovaní predmetu získa vedomosti, zručnosti a kompetencie, t.j. dokáže:
Vedomosti
Definovať a aplikovať základné didaktické zásady, metódy, formy a prostriedky vo vyučovacom procese vysokoškolských odborných predmetov. Identifikovať a špecifikovať edukačné postupy vysokoškolského učiteľa, zamerané na efektívne riadenie výučby, pedagogickú diagnostiku a hodnotenie výsledkov vzdelávania. Rozpoznať rôzne prístupy k pedagogickej evaluácii a ich vplyv na zlepšenie kvality vzdelávacieho procesu na vysokej škole.
Zručnosti
Implementovať účinné edukačné metódy a techniky do výučby odborných predmetov, prispôsobené potrebám vysokoškolských študentov. Vykonávať pedagogickú diagnostiku, hodnotiť pokrok študentov a aplikovať vhodné evalvačné metódy na zlepšenie výsledkov vzdelávania. Analyzovať a reflektovať vlastný vyučovací proces, identifikovať oblasti na zlepšenie a zefektívnenie výučby odborných predmetov, vrátane racionalizácie časovej a obsahovej štruktúry výučby. Prezentovať konkrétne návrhy na zefektívnenie vyučovacieho procesu, vrátane využívania nových technológií a inovatívnych pedagogických prístupov.
Kompetencie
Sebavedome a efektívne riadiť výučbu vysokoškolských predmetov, aplikujúc edukačné spôsobilosti zohľadňujúce špecifiká vzdelávania na vysokej škole. Kriticky reflektovať vlastnú pedagogickú prax a výsledky vzdelávania študentov s cieľom zlepšiť výučbové postupy a dosiahnuť vyššiu kvalitu vzdelávacieho procesu. Aplikovať inovatívne riešenia na racionalizáciu a zefektívnenie vyučovacieho procesu, s cieľom zvýšiť angažovanosť a úspešnosť vysokoškolských študentov.
Aktívna účasť na cvičeniach.
slovenský, anglický
V prípade nutnosti je predmet realizovaný dištančnou formou výučby.
1. dizajnovanie biologického experimentu, legislatívny a etický rámec biologických experimentov
2. formulovanie vedeckej hypotézy a stratégia vhodnej experimentálnej metódy pre dosiahnutie cieľov
3. výber vhodného experimentálneho zvieraťa pre dosiahnutie cieľov experimentu
4. výber vhodnej metódy odberu a spracovania biologického materiálu (izolácia tkaniva, fixácia, zmrazovanie, spracovanie a krájanie vzorky)
5. imunoznačenie buniek a tkanív pre svetelnú, fluorescenčnú a elektrónovú mikroskopiu
6. dizajnovanie a príprava sond pre in situ hybridizáciu
7. metódy zobrazovania buniek a tkanív epifluorescenčnou mikroskopiou
8. metódy zobrazovania buniek a tkanív pomocou transmisnej elektrónovej mikroskopie
9. metódy zobrazovania buniek a tkanív pomocou skenovacej elektrónovej mikroskopie
10. využitie transgénnych zvierat v experimentálnom výskume
11. analýza obrazu pomocou softvéru ImageJ, tvorba obrazového výstupu
12. kvantifikácia a štatistické analýzy
Naučiť študentov dizajnovať a zrealizovať experiment s využitím zobrazovacích metód v oblasti biomedicínskeho výskumu.
Aktívne zapojenie sa do popularizácie vedy.
Preukázaná spôsobilosť prezentovať vedu laickej verejnosti, využívať interaktívne metódy vedeckej komunikácie, identifikovať cieľovú skupinu a prispôsobiť komunikačný jazyk úrovni odborných vedomostí. Doktorand dokáže vzbudiť záujem a motivovať špecifické cieľové skupiny v oblasti svojho vedeckého pôsobenia ale aj v širšom kontexte vedy.
Práca v organizačnom výbore konferencie.
Doktorand prácou v organizačnom výbore konferencie preukazuje spôsobilosti a kompetentnosti organizovať samostatne či v tíme vedecké alebo odborné podujatie, zvládnuť realizáciu z hľadiska času a obsahu, efektívne komunikovať slovom a písmom rôznymi technickými prostriedkami podľa potreby aj v cudzom jazyku na odbornej úrovni s rôznymi typmi ľudí, v prípade potreby správne odporúčať riešenia alebo samostatne rozhodovať.
Priama pedagogická činnosť 1 semestrohodina
Pedagogickou činnosťou doktorand preukazuje spôsobilosť prenášať a integrovať poznanie z vlastného študijného odboru do vzdelávania. Je schopný vybrať a aplikovať správne techniky a stratégie manažmentu študijnej skupiny, vysokoškolského vzdelávania a hodnotenia výsledkov vzdelávania. Je spôsobilý navrhnúť a realizovať časť vzdelávacieho procesu v súlade s aktuálnymi trendmi vysokoškolského vzdelávania a požiadavkami kladenými na úroveň komunikačných a digitálnych kompetentností.
Priama pedagogická činnosť 2 semestrohodiny
Pedagogickou činnosťou doktorand preukazuje spôsobilosť prenášať a integrovať poznanie z vlastného študijného odboru do vzdelávania. Je schopný vybrať a aplikovať správne techniky a stratégie manažmentu študijnej skupiny, vysokoškolského vzdelávania a hodnotenia výsledkov vzdelávania. Je spôsobilý navrhnúť a realizovať časť vzdelávacieho procesu v súlade s aktuálnymi trendmi vysokoškolského vzdelávania a požiadavkami kladenými na úroveň komunikačných a digitálnych kompetentností.
Priama pedagogická činnosť 3 semestrohodiny
Pedagogickou činnosťou doktorand preukazuje spôsobilosť prenášať a integrovať poznanie z vlastného študijného odboru do vzdelávania. Je schopný vybrať a aplikovať správne techniky a stratégie manažmentu študijnej skupiny, vysokoškolského vzdelávania a hodnotenia výsledkov vzdelávania. Je spôsobilý navrhnúť a realizovať časť vzdelávacieho procesu v súlade s aktuálnymi trendmi vysokoškolského vzdelávania a požiadavkami kladenými na úroveň komunikačných a digitálnych kompetentností.
Priama pedagogická činnosť 4 semestrohodiny
Pedagogickou činnosťou doktorand preukazuje spôsobilosť prenášať a integrovať poznanie z vlastného študijného odboru do vzdelávania. Je schopný vybrať a aplikovať správne techniky a stratégie manažmentu študijnej skupiny, vysokoškolského vzdelávania a hodnotenia výsledkov vzdelávania. Je spôsobilý navrhnúť a realizovať časť vzdelávacieho procesu v súlade s aktuálnymi trendmi vysokoškolského vzdelávania a požiadavkami kladenými na úroveň komunikačných a digitálnych kompetentností.
Alexitch, L. R. (2005). Applying social psychology to education. Social Psychology.–Еd.: Schneider F., Gruman J., Coutts L.–Sage Publications, Inc, 205-228.
Fry, H., Ketteridge, S., & Marshall, S. (2008). A handbook for teaching and learning in higher education: Enhancing academic practice. Routledge.
Mareš, J.: Pedagogická psychologie. Portál, 2013.
Kniha psychologie. Universum, 2014
Čáp, J., Mareš, J.: Psychologie pro učitele. Praha: Portál 2007.
Vágnerová, M.: Školní poradenská psychológie pro pedagogy. Praha: Karolínum 2005.
Cuevas, J. A., Childers, G., & Dawson, B. L. (2023). A rationale for promoting cognitive science in teacher education: Deconstructing prevailing learning myths and advancing research-based practices. Trends in neuroscience and education, 100209.
University teacher and his work in the teaching process with a focus on:
teacher in relation to himself (cognitive, personality, social competencies and competencies in the use of methods), in relation to students and as part of the teacher-student relationship based on selected areas of cognitive psychology, psychology of emotions and motivation, developmental psychology, social psychology , educational psychology and health psychology with application to the university environment
Prípadová štúdia, mikrovýstup, jeho analýza
Aktuálne úpravy predmetu sú uvedené v elektronickej nástenke predmetu.
slovenský
Vysokoškolský učiteľ a jeho pôsobenie v procese vyučovania so zameraním sa na:
učiteľa vo vzťahu k sebe samému (kognitívnym, osobnostným, sociálnym kompetenciám a kompetenciám v oblasti využívania metód), vo vzťahu k študentom a ako súčasť vzťahu učiteľ-žiak na základe vybraných oblastí z kognitívnej psychológie, psychológie emócií a motivácie, vývinovej psychológie, sociálnej psychológie, pedagogickej psychológie a psychológie zdravia s aplikáciou na vysokoškolské prostredie
Obsah predmetu vychádza z vybraných psychologických poznatkov z kognitívnej psychológie, psychológie emócií a motivácie, psychológie osobnosti, vývinovej, sociálnej, pedagogickej psychológie a psychológie zdravia. Výučba je realizovaná kombináciou prednášok s interaktívnymi, zážitkovými metódami, diskusiou, otvorenou komunikáciou pri vzájomnom rešpekte, podpore samostatnosti, aktivity a motivácie študentov.
Osnova:
Vysokoškolský učiteľ a jeho pôsobenie v procese vyučovania so zameraním sa na:
učiteľa vo vzťahu k sebe samému (kognitívnym, osobnostným, sociálnym kompetenciám a kompetenciám v oblasti využívania metód), vo vzťahu k študentom a ako súčasť vzťahu učiteľ-žiak na základe vybraných oblastí z kognitívnej psychológie, psychológie emócií a motivácie, vývinovej psychológie, sociálnej psychológie, pedagogickej psychológie a psychológie zdravia s aplikáciou na vysokoškolské prostredie.
Študenti po absolvovaní kurzu nadobudnú vedomosti umožňujúce porozumieť, zhrnúť a vysvetliť vybrané psychologické poznatky z kognitívnej psychológie, psychológie emócií a motivácie, psychológie osobnosti, vývinovej, sociálnej, pedagogickej psychológie a psychológie zdravia. Osvoja si zručnosti aplikovať uvedené psychologické poznatky nevyhnutné pre profesionálny, kompetentný výkon vysokoškolskej učiteľskej praxe doktorandov a rozvinú si kompetencie vytvoriť a zrealizovať výučbu odbornej témy s uplatneným psychologických poznatkov ako aj hodnotiť svoj výkon a výkon svojich spolužiakov formou konštruktívnej spätnej väzby.
Publikácia prijatá v časopise kategórie Q1 ako spoluautor.
Publikovaním v časopise kategórie Q1 ako spoluautor doktorand preukazuje vysokú mieru spôsobilosti identifikovať, vyhodnotiť, aplikovať správne vedecké metódy alebo metodiku výskumu. Demonštruje spôsobilosť reflektovať vedecký problém využitím najnovších prístupov a ich kritickým aplikovaním. Preukazuje kompetentnosť inovatívnym spôsobom využívať jestvujúce teórie a koncepty, ako aj generovať nové originálne vedecké poznanie, ktoré dokáže publikovať podľa najvyšších kvalitatívnych a etických štandardov odboru. Doktorand preukazuje spôsobilosť kriticky vyhodnotiť a reagovať na podnety recenzentov, finalizovať vlastné myšlienky.
Publikácia prijatá v časopise kategórie Q1 ako prvý alebo korešpondujúci autor.
Publikovaním v časopise kategórie Q1 ako prvý alebo korešpondujúci autor doktorand preukazuje vysokú mieru spôsobilosti identifikovať, vyhodnotiť, aplikovať správne vedecké metódy alebo metodiku výskumu. Demonštruje spôsobilosť reflektovať vedecký problém využitím najnovších prístupov a ich kritickým aplikovaním. Preukazuje kompetentnosť inovatívnym spôsobom využívať jestvujúce teórie a koncepty, ako aj generovať nové originálne vedecké poznanie, ktoré dokáže publikovať podľa najvyšších kvalitatívnych a etických štandardov odboru. Doktorand preukazuje spôsobilosť kriticky vyhodnotiť a reagovať na podnety recenzentov, finalizovať vlastné myšlienky
Publikácia prijatá v časopise kategórie Q2 ako spoluautor.
Publikovaním v časopise kategórie Q2 ako spoluautor doktorand preukazuje vysokú mieru spôsobilosti identifikovať, vyhodnotiť, aplikovať správne vedecké metódy alebo metodiku výskumu. Demonštruje spôsobilosť reflektovať vedecký problém využitím najnovších prístupov a ich kritickým aplikovaním. Preukazuje kompetentnosť inovatívnym spôsobom využívať jestvujúce teórie a koncepty, ako aj generovať nové originálne vedecké poznanie, ktoré dokáže publikovať podľa najvyšších kvalitatívnych a etických štandardov odboru. Doktorand preukazuje spôsobilosť kriticky vyhodnotiť a reagovať na podnety recenzentov, finalizovať vlastné myšlienky.
Publikácia prijatá v časopise kategórie Q2 ako prvý alebo korešpondujúci autor
Publikovaním v časopise kategórie Q2 ako prvý alebo korešpondujúci autor doktorand preukazuje vysokú mieru spôsobilosti identifikovať, vyhodnotiť, aplikovať správne vedecké metódy alebo metodiku výskumu. Demonštruje spôsobilosť reflektovať vedecký problém využitím najnovších prístupov a ich kritickým aplikovaním. Preukazuje kompetentnosť inovatívnym spôsobom využívať jestvujúce teórie a koncepty, ako aj generovať nové originálne vedecké poznanie, ktoré dokáže publikovať podľa najvyšších kvalitatívnych a etických štandardov odboru. Doktorand preukazuje spôsobilosť kriticky vyhodnotiť a reagovať na podnety recenzentov, finalizovať vlastné myšlienky.
Publikácia prijatá v časopise kategórie Q3 ako spoluautor.
Publikovaním v časopise kategórie Q3 ako spoluautor doktorand preukazuje vysokú mieru spôsobilosti identifikovať, vyhodnotiť, aplikovať správne vedecké metódy alebo metodiku výskumu. Demonštruje spôsobilosť reflektovať vedecký problém využitím najnovších prístupov a ich kritickým aplikovaním. Preukazuje kompetentnosť inovatívnym spôsobom využívať jestvujúce teórie a koncepty, ako aj generovať nové originálne vedecké poznanie, ktoré dokáže publikovať podľa najvyšších kvalitatívnych a etických štandardov odboru. Doktorand preukazuje spôsobilosť kriticky vyhodnotiť a reagovať na podnety recenzentov, finalizovať vlastné myšlienky.
Publikácia prijatá v časopise kategórie Q3 ako prvý alebo korešpondujúci autor
Publikovaním v časopise kategórie Q3 ako prvý alebo korešpondujúci autor doktorand preukazuje vysokú mieru spôsobilosti identifikovať, vyhodnotiť, aplikovať správne vedecké metódy alebo metodiku výskumu. Demonštruje spôsobilosť reflektovať vedecký problém využitím najnovších prístupov a ich kritickým aplikovaním. Preukazuje kompetentnosť inovatívnym spôsobom využívať jestvujúce teórie a koncepty, ako aj generovať nové originálne vedecké poznanie, ktoré dokáže publikovať podľa najvyšších kvalitatívnych a etických štandardov odboru. Doktorand preukazuje spôsobilosť kriticky vyhodnotiť a reagovať na podnety recenzentov, finalizovať vlastné myšlienky.
Publikácia prijatá v časopise kategórie Q4 ako spoluautor.
Publikovaním v časopise kategórie Q4 ako spoluautor doktorand preukazuje vysokú mieru spôsobilosti identifikovať, vyhodnotiť, aplikovať správne vedecké metódy alebo metodiku výskumu. Demonštruje spôsobilosť reflektovať vedecký problém využitím najnovších prístupov a ich kritickým aplikovaním. Preukazuje kompetentnosť inovatívnym spôsobom využívať jestvujúce teórie a koncepty, ako aj generovať nové originálne vedecké poznanie, ktoré dokáže publikovať podľa najvyšších kvalitatívnych a etických štandardov odboru. Doktorand preukazuje spôsobilosť kriticky vyhodnotiť a reagovať na podnety recenzentov, finalizovať vlastné myšlienky.
Publikácia prijatá v časopise kategórie Q4 ako prvý alebo korešpondujúci autor
Publikovaním v časopise kategórie Q43 ako prvý alebo korešpondujúci autor doktorand preukazuje vysokú mieru spôsobilosti identifikovať, vyhodnotiť, aplikovať správne vedecké metódy alebo metodiku výskumu. Demonštruje spôsobilosť reflektovať vedecký problém využitím najnovších prístupov a ich kritickým aplikovaním. Preukazuje kompetentnosť inovatívnym spôsobom využívať jestvujúce teórie a koncepty, ako aj generovať nové originálne vedecké poznanie, ktoré dokáže publikovať podľa najvyšších kvalitatívnych a etických štandardov odboru. Doktorand preukazuje spôsobilosť kriticky vyhodnotiť a reagovať na podnety recenzentov, finalizovať vlastné myšlienky.
Cresti M.: Sexual Plant Reproduction. - Springer Science, 2012.
Pullaiah T: Plant Reproduction, 2nd. ed., Scientific Publishers, 2019.
Erdelská O., Švubová R., Mártonfiová L., Lux, A.: Embryológia krytosemenných rastlín, Veda, Bratislava 2017.
Horandl E., Grossniklaus U., van Dijk P. J., Sharbel T. F.: Apomixis. Evolution, Mechanisms and Perspectives. - A.R.G. Gantner Verlag K. G., Rugell, Liechtenstein, 2007.
Richards A.J.: Plant Breeding Systems. 2nd. ed. - Chapman & Hall, London, 1997.
Simpson M. G.: Plant Systematics, 3rd ed. - Academic Press, 2019.
Stuessy T. F., Crawford D. J., Soltis D. E., Soltis P. S.: Plant Systematics. The Origin, Interpretation, and Ordering of Plant Biodiversity. - Koeltz Scienfific Books, 2014.
.
Absolvovanie predmetu je realizované prednáškami a samoštúdiom literatúry. Praktické otázky sú riešené v súvislostiach, ktoré aktuálne vyplývajú z témy riešenej dizertačnej práce a jej súvislosti s reprodukciou rastlín. Na záver prednášok sa realizuje ústna skúška.
slovenský a anglický
.
1. História reprodukčnej biológie rastlín.
2. Evolučné trendy v reprodukcii rastlín.
3. Reprodukčné štruktúry výtrusných a semenných rastlín.
4. Samičí a samčí gametofyt. Oplodnenie, endosperm, embryo.
5. Fenologické reprodukčné dáta.
6. Ultrafialová reflektancia a absorbancia reprodukčných štruktúr.
7. Polinačné vektory. Nektár.
8. Rozširovanie rastlín.
9. Rozmnožovacie systémy rastlín. Panmixia, samooplodnenie, apomixia.
10. Evolučný význam jednotlivých rozmnožovacích systémov.
11. Reprodukcia rastlín a šľachtenie.
12. Aplikácia poznatkov o reprodukcii rastlín v poľnohospodárstve.
Získať hlboké znalosti o evolúcii reprodukčných systémov, mechanizmoch a procesoch reprodukcie a dopadoch rôznych rozmnožovacích systémov na evolúciu taxónov. Vedieť syntetizovať poznatky z embryológie rastlín a evolučnej biológie pre lepšie pochopenie otázok reprodukčnej biológie. Spoznať vplyv ekologických faktorov na reprodukciu rastlín a vzťahy medzi rastlinami a živočíchmi, ktoré sa týkajú rastlinnej reprodukcie. Vedieť aplikovať získané poznatky na riešenie rôznych úloh v rámci fyziológie rastlín, ale aj v podmienkach praxe, napr. v poľnohospodárstve, lesníctve, pri hodnotení biot a v ochrane prírody.
.
Publikácia uverejnená v recenzovanom zahraničnom alebo domácom zborníku ako autor/spoluautor
Publikovaním v recenzovanom zahraničnom alebo domácom zborníku ako autor/spoluautor doktorand preukazuje vysokú mieru spôsobilosti identifikovať, vyhodnotiť, aplikovať správne vedecké metódy alebo metodiku výskumu. Demonštruje spôsobilosť reflektovať vedecký problém využitím najnovších prístupov a ich kritickým aplikovaním. Preukazuje kompetentnosť inovatívnym spôsobom využívať jestvujúce teórie a koncepty, ako aj generovať nové originálne vedecké poznanie, ktoré dokáže publikovať podľa najvyšších kvalitatívnych a etických štandardov odboru. Doktorand preukazuje spôsobilosť kriticky vyhodnotiť a reagovať na podnety recenzentov, finalizovať vlastné myšlienky
Získaná citácia registrovaná v SCI alebo Scopus
Získanie citácie preukazuje široké a veľmi dobre podložené vedecké poznanie v skúmanej oblasti, založené na spôsobilosti formulovať výskumné otázky, reflektovať vedecký problém takým spôsobom, ktorý generuje nové poznanie. Zároveň citácia v indexovanom zdroji preukazuje kompetentnosti komunikovať nové poznanie, ktoré je významným príspevkom k vedeckému poznaniu, na najvyššej expertnej úrovni
Spoluriešiteľ domáceho projektu.
Doktorand preukazuje spôsobilosť podieľať sa na tímovej práci, prinášať vlastný vklad do riešenia projektového zámeru a preberať zodpovednosť za pridelené úlohy. Riešením domáceho projektu nadobúda spôsobilosť realizovať projektový zámer podľa stanoveného postupu, dodržiavať harmonogram projektu, koordinovať vlastnú činnosť so spolupracovníkmi, podieľať sa na tvorbe výstupov. Doktorand získava cenné skúsenosti z praktického chodu grantového projektu.
Spoluriešiteľ interného VVGS grantu.
Doktorand preukazuje spôsobilosť podieľať sa na tímovej práci, prinášať vlastný vklad do riešenia projektového zámeru v rámci interného grantového systému na UPJŠ. Riešením interného VVGS grantu nadobúda spôsobilosť realizovať projektový zámer podľa stanoveného postupu, dodržiavať harmonogram projektu, koordinovať vlastnú činnosť so spolupracovníkmi, podieľať sa na tvorbe výstupov. Doktorand získava cenné skúsenosti z praktického chodu grantového projektu.
Členstvo v riešiteľskom kolektíve medzinárodného projektu.
Aktívne zapojenie riešením konkrétnej úlohy v rámci kolektívu riešiteľov medzinárodného projektu. Doktorand preukazuje spôsobilosť tímovej práce, preberania zodpovednosti za pridelenú úlohu, dodržiavania časového harmonogramu a plnenia výstupov projektu. Doktorand získava osobné skúsenosti z realizácie medzinárodného projektu, participácie na jeho kľúčových etapách, tvorbe merateľných výstupov, grantového financovania vedy.
Wink M, Biochemistry of Plant Secondary Metabolism. Sheffield Academic Press .
Wink M, Functions of Plant Secondary Metabolites and their Expoitation in Biotechnology. Sheffield Academic Press 1999.
Taiz L, Zeiger E, Plant Physiology. 4th ed. Sunderland, Sinauer Ass. 2006
1. Vypracovanie jednej semestrálnej práce na vopred zadanú tému.
2. Skúška predmetu prebieha ústnou formou na náhodne vytiahnutú otázku. Študent prednesie tému svojej semestrálnej práce a následne prebehne diskusia s vyučujúcim na danú tému.
slovenský, anglický
1. Primárny a sekundárny metabolizmus rastlín a ich biosyntéza
2. Enzymatické dráhy a komplexy enzýmov (metabolóny).
3. Terpény
4. Fenolové látky, tvorba lignínov
5. Flavonoidy, izoflavonoidy
6. Kondenzované taníny, antokyány
7. Dusíkaté sekundárne látky, alkaloidy
8. Polyketidy
9. Sekundárne látky v podmienkach stresu
10. Extrakcia sekundárnych látok, polarita.
11. Absorpčné vlastnosti látok, UV-VIS spektrum
12. Analýza sekundárnych látok
13. Nové poznatky o rastlinných metabolitoch, vybraná téma z najnovších publikácií z odboru.
Študent aktualizuje, rozšíri a upevní poznatky o biosyntéze sekundárnych látok v rastlinách s dôrazom na ich akumuláciu, reguláciu a význam pre rastlinu aj pre človeka. Prejaviť schopnosť práce s vedeckou literatúrou a spracovania získaných informácií.
Spoluriešiteľ projektu aplikovaného výskumu
Doktorand preukazuje spôsobilosť podieľať sa na tímovej práci, prinášať vlastný vklad do riešenia projektového zámeru aplikovaného výskumu a preberať zodpovednosť za pridelené úlohy. Riešením projektu aplikovaného výskumu nadobúda spôsobilosť realizovať projektový zámer podľa stanoveného postupu, dodržiavať harmonogram projektu, koordinovať vlastnú činnosť so spolupracovníkmi, podieľať sa na tvorbe výstupov aplikovaného výskumu. Doktorand získava cenné skúsenosti z praktického chodu grantového projektu so zameraním na aplikovaný výskum.
Oboznámiť študentov doktorandského štúdia s najnovšími poznatkami z biochémie mikroorganizmov.
1. Black, J. G.: Microbiology, Wiley & Sons, Inc., 2008.
2. Johnson, T. R., Case, J.: Laboratory Experiments in Microbiology, 9th Ed., Pearson, 2010.
3. Kayser, F. H., Bienz, K. A., Eckert, J., Zinkernagel, R. M.: Medical Microbiology, Thieme, Stitgart-New York, 2001.
4. Levinson, W.: Review of Medical Microbiology and Immunology, McGraw-Hill International Edition, 2010.
5. Šilhánková, L.: Mikrobiológie pro potravináře a biotechnology. 3. rev. vyd. Praha: Academia, 2002.
6. Willey, J. M., Sherwood, L. M., Woolverton, C. J.: Prescott, Harley, and Klein´s Microbiology, McGraw-Hill International Edition, 2008.
Vypracovanie seminárnej práce na tému súvisiacu s predmetom biochémia mikroorganizmov a s témou
doktorandského štúdia študenta. Diskusia so skúšajúcim o téme
seminárnej práce, v ktorej študent preukáže, že má dostatočné
vedomosti z predmetu.
slovenský
Výučba sa realizuje prezenčne alebo dištančne s využitím nástroja MS Teams. Formu výučby upresní vyučujúci na začiatku semestra a priebežne aktualizuje.
Diverzita mikrobiálneho sveta, mikrobiálna evolúcia, taxonómia a diverzita (mikrobiálna evolúcia, úvod do mikrobiálnej klasifikácie, hodnotenie mikrobiálnej fylogenézy). Ekológia a symbióza. Biogeochemické cykly a úvod do mikrobiálnej ekológie (biogeochemické cykly, fyzikálne prostredia, mikrobiálne technológie a jej metódy). Mikrobiálne interakcie (vzájomné ovplyvňovanie človeka a mikroorganizmov, normálna mikroflóra ľudského tela). Antimikrobiálna chemoterapia (vývoj chemoterapie, všeobecná charakteristika antimikrobiálnych liečiv, stanovenie výšky antimikrobiálnej aktivity, antimikrobiálne lieky, faktor ovplyvňujúci účinnosť antimikrobiálnych liečiv, lieková rezistencia, antimykotické, antivírusové, antiprotozoálne liečivá). Potraviny a priemyselná mikrobiológia, mikrobiologické parametre potravín, mikroorganizmy ako potraviny a zmeny v potravinách.
Oboznámiť študentov doktorandského štúdia s najnovšími poznatkami z biochémie mikroorganizmov.
Seminárna práca.
Murphy A.S. et al. The plant plasma membrane. Springer-Verlag Berlin Heidelberg 2011;
Taiz L.et al. Plant Physiology and Development. Sixth editon. Sinauer ass.,Sunderland 2014;
Bhatla S.C., Lal M.A. Plant Physiology, development and metabolism. Springer Nature Singapore Pte Ltd. 2018;
Články vo vedeckých časopisoch.
1. Vypracovanie jednej semestrálnej práce na vopred zadanú tému.
2. Skúška predmetu prebieha ústnou formou na náhodne vytiahnutú otázku. Študent prednesie tému svojej semestrálnej práce a následne prebehne diskusia s vyučujúcim na danú tému.
slovenský, anglický
1. Metabolizmus, metabolóm, traskriptóm a ich význam pre fyziológiu rastlín.
2. Fotosyntéza: vplyv svetla na rast a vývin rastlín, odpoveď na ekologické faktory
3. Fotosyntéza II.: Enzým Rubisco a jeho význam pre fotosyntetické procesy. Metabolické adaptácie a ich význam pre rastliny.
4. Membrány rastlín a ich fyziologický význam. Transportné procesy rastlín.
5. Príjem dusíka, redukcia dusíka a ich regulácie, funkcia NO a ďalších dusíkatých látok.
6. Primárna a sekundárna asimilácia dusíka, regulácia metabolizmu dusíka a uhlíka. Súvislosti medzi fotosyntézou a metabolizmom dusíka.
7. Aminokyseliny, ich tvorba, transport, akumulácia a význam voľných aminokyselín
8. Význam katabolických procesov v listoch rastlín
9. Metabolizmus lipidov, význam lipidov, peroxidácia lipidov. Stresové hormóny, jazmonáty
10. Oxidačný stres, antioxidačné látky a enzýmy.
11. Stresové metabolity, fytoalexíny
12. Regulácia kvitnutia rastlín, rastlinné biorytmy
13. Nové poznatky z fyziológie rastlín, vybraná téma z najnovších publikácií z odboru.
Updating, expanding and consolidating knowledge about the mechanisms of physiological processes in plants. Demonstrate the ability to work with scientific literature and process the information obtained.
Aktualizácia, rozšírenie a upevnenie poznatkov o mechanizmoch fyziologických procesov
v rastlinách. Prejaviť schopnosť práce s vedeckou literatúrou a spracovania získaných informácií.
Vedenie študenta v rámci SOČ alebo ŠVOČ.
Vedením študenta v rámci SOČ alebo ŠVOČ doktorand preukazuje široké a vedecky podložené poznanie v študijnom odbore, ako aj poznanie širokého spektra metód a prístupov. Preukazuje spôsobilosť kriticky posúdiť odborný problém a jeho navrhované riešenie, ako aj vyhodnotiť ho a prípadne navrhnúť iné riešenie. Aplikuje poznatky a spôsobilosti z oblasti pedagogických vied do vlastného odboru.
Vedecká práca po zaslaní do redakcie vedeckého časopisu ako autor/spoluautor.
Zaslaním rukopisu do redakcie vedeckého časopisu ako autor/spoluautor doktorand preukazuje vysokú mieru spôsobilosti identifikovať, vyhodnotiť, aplikovať správne vedecké metódy alebo metodiku výskumu. Demonštruje spôsobilosť reflektovať vedecký problém využitím najnovších prístupov a ich kritickým aplikovaním. Preukazuje kompetentnosť inovatívnym spôsobom využívať jestvujúce teórie a koncepty, ako aj generovať nové originálne vedecké poznanie, ktoré dokáže publikovať podľa najvyšších kvalitatívnych a etických štandardov odboru. Doktorand preukazuje spôsobilosť formulovať vlastné myšlienky do štruktúrovanej podoby
Vypracovanie oponentského posudku na záverečnú prácu.
Doktorand preukazuje široké a vedecky podložené poznanie v študijnom odbore, ako aj poznanie širokého spektra metód a prístupov. Preukazuje spôsobilosť kriticky posúdiť odborný problém a jeho navrhované riešenie, ako aj vyhodnotiť ho a prípadne odporúčiť iné riešenie. Aplikuje poznatky a spôsobilosti z oblasti pedagogických vied do vlastného odboru.
Vystúpenie na seminári.
Aktívnou účasťou seminári doktorand preukazuje spôsobilosť identifikovať, vyhodnotiť, aplikovať správne vedecké metódy alebo metodiku výskumu vo svojom vednom odbore. Demonštruje spôsobilosť reflektovať konkrétny vedecký problém využitím najnovších prístupov a ich kritickým aplikovaním. Preukazuje kompetentnosť inovatívnym spôsobom využívať jestvujúce teórie a koncepty, ako aj generovať nové originálne vedecké poznanie a komunikovať výsledky výskumu adekvátnymi prostriedkami a prostredníctvom slovenského alebo cudzieho jazyka.
Vedenie záverečnej práce.
Vedením záverečnej práce doktorand preukazuje široké a vedecky podložené poznanie v študijnom odbore, ako aj poznanie širokého spektra metód a prístupov. Preukazuje spôsobilosť kriticky posúdiť odborný problém a jeho navrhované riešenie, ako aj vyhodnotiť ho a prípadne navrhnúť iné riešenie. Aplikuje poznatky a spôsobilosti z oblasti pedagogických vied do vlastného odboru.
Publikácia prijatá v zahraničnom časopise ako autor/spoluautor.
Publikovaním v zahraničnom časopise ako autor/spoluautor doktorand preukazuje vysokú mieru spôsobilosti identifikovať, vyhodnotiť, aplikovať správne vedecké metódy alebo metodiku výskumu. Demonštruje spôsobilosť reflektovať vedecký problém využitím najnovších prístupov a ich kritickým aplikovaním. Preukazuje kompetentnosť inovatívnym spôsobom využívať jestvujúce teórie a koncepty, ako aj generovať nové originálne vedecké poznanie, ktoré dokáže publikovať podľa najvyšších kvalitatívnych a etických štandardov odboru. Doktorand preukazuje spôsobilosť kriticky vyhodnotiť a reagovať na podnety recenzentov, finalizovať vlastné myšlienky.
Zodpovedný riešiteľ interného VVGS grantu.
Doktorand preukazuje spôsobilosť k vlastnému výskumnému problému spracovať úspešnú žiadosť v rámci interného grantového systému na UPJŠ. Získava zručnosti s návrhom výskumných etáp, ich časového harmonogramu, merateľných výstupov a adekvátneho rozloženia finančných prostriedkov. Samotným riešením interného VVGS grantu nadobúda spôsobilosť realizovať projektový zámer podľa stanoveného postupu, zodpovedať za dosiahnutie stanovených výstupov. Doktorand si ako zodpovedný riešiteľ osvojuje kompetencie v riadení projektu, jeho administrácii, prezentovaní výsledkov.
Absolvovanie zahraničného študijného pobytu v trvaní menej ako 30 dní.
Absolvovaním krátkodobejšieho študijného pobytu doktorand preukazuje spôsobilosť reflektovať výskumné problémy a kriticky pracovať so zdrojmi na expertnej úrovni a v interdisciplinárnom kontexte, pričom je schopný generovať nové poznanie. Je spôsobilý aktívne komunikovať na expertnej úrovni vo viac ako jednom jazyku. Koná ako zodpovedný nezávislý vedec, pracuje samostatne i v skupine s cieľom posúvať hranice poznania a prenášať ich do iných oblastí výskumu, do praxe i smerom k širšej verejnosti. Dokáže kompetentne argumentovať a vysvetliť svoje myšlienky.
Absolvovanie zahraničného študijného pobytu v trvaní viac ako 30 dní.
Absolvovaním študijného pobytu doktorand preukazuje spôsobilosť reflektovať výskumné problémy a kriticky pracovať so zdrojmi na expertnej úrovni a v interdisciplinárnom kontexte, pričom je schopný generovať nové poznanie. Je spôsobilý aktívne komunikovať na expertnej úrovni vo viac ako jednom jazyku. Koná ako zodpovedný nezávislý vedec, pracuje samostatne i v skupine s cieľom posúvať hranice poznania a prenášať ich do iných oblastí výskumu, do praxe i smerom k širšej verejnosti. Dokáže kompetentne argumentovať a vysvetliť svoje myšlienky