Predmet štátnej skúšky
Kód:
ÚBEV/DPO/14
Názov:
Diplomová práca a jej obhajoba
Študijný program:
botanika a fyziológia rastlín
genetika a molekulárna cytológia
zoológia a fyziológia živočíchov
botanika a fyziológia rastlín
všeobecná ekológia a ekológia jedinca a populácií
Predmet štátnej skúšky
Kód:
ÚBEV/GMC/15
Názov:
Genetika a molekulárna cytológia
Študijný program:
genetika a molekulárna cytológia
Podmieňujúce predmety:
ÚBEV/GEP/12 a ÚBEV/MOG/03 a ÚBEV/FG/14
Obsahová náplň štátnicového predmetu:

1. Modelové organizmy v genetike a ich základné vlastnosti.

2. Escherichia coli ako model v genetike prokaryotických organizmov.

3. Modelové eukaryotické organizmy – ich všeobecná charakteristika a význam.

4. Saccharomyces cerevisiae ako modelový organizmus. Genetická chrakteristika a význam.

5. Caenorhabditis elegans ako modelový organizmus. Genetická chrakteristika a význam.

6. Drosophila melanogaster ako modelový organizmus. Genetická chrakteristika a význam.

7. Mus musculus ako modelový organizmus. Genetická chrakteristika a význam.

8. Arabidopsis thaliana ako modelový organizmus. Genetická chrakteristika a význam.

9. Poznatky zo sekvenovania genómov eukaryotických modelových organizmov.

10. Základná charakteristika ľudského genómu a jeho vzťah k ostatným sekvenovaným genómom.

11. Evolučná konzervatívnosť genetických procesov. Ortológne a paralógne gény.

12. Evolúcia génov a genómov. Nukleotidová substitúcia a duplikácia génov.

13. Mutácie ako zdroj variability. Introny a evolúcia.

14. Evolúcia reprodukčných systémov.

15. Evolučné mechanizmy na úrovni populácií.

16. Genofond populácie a faktory, ktoré ho podmieňujú. Fenotypové a genotypové variácie v prírodných populáciách, jednolokusová (Mendelovská) versus multilokusová (kvantitatívna) dedičnosť.

17. Panmixia. Genetické dôsledky panmixie vo vybraných populáciách. Hardyho-Weinbergov zákon.

18. Inbríding. Koeficient inbrídingu. Dôsledky inbrídingu na genotypové zloženie populácie. Bernsteinov-Wrightov zákon. Pozitívna a negatívna homogamia.

19. Mutácie ako populačno-genetický činiteľ. Mutačný tlak, frekvencia a typy mutácií z hľadiska selekčného významu. Mutačná rovnováha.

20. Selekcia. Koeficient selekcie a fitness. Typy selekcie (proti dominantnému fenotypu, proti recesívnemu fenotypu, proti homozygotom, proti heterozygotom) a ich efekt.

20. Migrácia. Genetické javy v ohraničených populáciách. Genetický drift a efekt zakladateľa.

21. Genetický polymorfizmus. Typy polymorfizmov, verejné STR a SNP databázy. „HapMap“ projekt. Možnosti a význam analýzy DNA polymorfizmov. Genotypovanie a sekvenovanie.

22. Genóm a funkčná genomika: sekvenované modelové organizmy, konceptuálny a metodologický prínos sekvenovania genómov, štrukturálna versus funkčná anotácia genómu •

23. Reverzná genetika na genómovej úrovni: tvorba mutantov a ich využitie vo funkčnej genomike

24. Transkriptomika: získavanie transkriptomických dát, analýza dát, “data mining“

25. Proteomika: získavanie proteomických dát, kvantitatívna versus kvalitatívna proteomika, analýza dát, data mining, proteínové siete

26. Metabolomika: získavanie metabolomických dát, kvantitatívna versus kvalitatívna metabolomika, analýza dát, data mining

27. Interaktóm, metódy mapovania proteín-proteínových interakcií.

28. Signalóm, transdukcia signálov, metódy štúdia signálnych dráh.

29. Biologické databázy a ďalšie zdroje pre funkčnú analýzu genómu. Príklady aplikácie funkčnej genomiky.

30. Bunkový cyklus. Genetická regulácia bunkového cyklu.

31. Diferenciácia buniek. Starnutie buniek.

32. Molekulové mechanizmy tvorby špecializovaných bunkových typov.

33. Genetická regulácia bunkovej diferenciácie a bunkového starnutia. Kmeňové bunky a ich význam.

34. Nádorové bunky a ich vlastnosti. Konverzia normálnej bunky na nádorovú.

35. Protoonkogény, onkogény, nádorové supresorové gény. Biologické markery malígneho procesu.

36. Genetické a bunkové základy imunity.