1. História botaniky. Štruktúra botanických vied. Hlavné prístupy ku klasifikácii rastlín. Umelé systémy, prirodzené systémy. Fenetika. Kladistika. Taxonomické dôkazy - štruktúrne a biochemické znaky: anatómia a morfológia orgánov rastlín. Hlavné princípy botanickej nomenklatúry.

2. Molekulárne prístupy v systematike rastlín. Jadrový a plastidový genóm a využitie sekvenačných dát ich kódujúcich a nekódujúcich úsekov a fingerprinting techník v systematike rastlín. Evolučné procesy a molekulárne vzorce v rastlinách.

4. Zonobiómy, hlavné typy vegetácie, vzorce distribúcie rastlín

5. Porovnávanie cievnatých a bezcievnatých rastlín z pohľadu ekofyziológie. Adaptácie na environmentálny stres

6. Vplyv abiotických faktorov vonkajšieho prostredia na rastliny a adaptácie rastlín na prostredie

7. Ekológia rastlinného spoločenstva, životné formy rastlín, štruktúra a funkcie ekosystémov

8. Evolúcia rastlinnej diverzity. Speciácia primárna a sekundárna. Reprodukčné mechanizmy rastlín a ich evolučné dôsledky. Hybridizácia, polyploidia, introgresia. Vegetatívne rozmnožovanie rastlín. Apomixia.

9. Evolúcia diverzity bezcievnych zelených rastlín. Hlavné skupiny rias, machorastov.

10. Symbióza v ríši rastlín a húb, rastové formy a ekológia lišajníkov

11. Úloha fotobionta a mykobionta v lichenizme, sekundárny metabolizmus lišajníkov

12. Evolučné tendencie životného cyklu cievnatých rastlín. Sporofyt a gametofyt hlavných skupín výtrusných cievnatých rastlín. Diverzita výtrusných cievnatých rastlín v minulosti a v súčasnosti.

13. Opelenie a oplodnenie, embryo a endosperm nahosemenných a krytosemenných rastlín.

14. Vznik semenných rastlín ako významný fylogenetický jav, hlavné evolučné skupiny. Cykasy, ginkgá, ihličiny a gnetumy.

15. Vznik a rozvoj krytosemenných rastlín. Bazálne fylogenetické vetvy a rastliny jednoklíčnolistové.

16. Fylogenéza a diferenciácia pravých (trikolpátnych) krytosemenných rastlín. Hlavné evolučné vetvy a príklady konkrétnych skupín.

17. Príjem a transport látok v rastlinách. Mechanizmy príjmu, kanály, pumpy, transportery. Transport látok v xyléme a floéme. Vplyv prostredia (pôda, atmosféra) na príjem látok.

18. Fotosyntéza. Svetlo ako hnacia sila, absorpcia svetla. Rozklad vody, cyklický a necyklický transport elektrónov. Transport protónov a tvorba ATP.

19. Metabolická fáza fotosyntézy. Calvinov cyklus, príčiny vzniku fotorespirácie. Adaptácie C4 rastlín a CAM rastlín. Tvorba sacharózy a škrobu.

20. Lipidy. Chemická štruktúra lipidov. Syntéza mastných kyselín, kompletizácia štrukturálnych lipidov. Suberín, kutín. Polyacetylény a polyketidy. Mobilizácia lipidov.7

21. Metabolizmus dusíka. Význam azotrofných symbióz. Nitrogenáza. Príjem a redukcia dusičnanov. Asimilácia dusíka (GS, GOGAT, GDH, AS). Transport dusíka. Signalizačná funkcia dusíkatých látok (NO, NO3, Glu).

22. Dusíkaté sekundárne metabolity odvodené od aminokyselín. Proteinogénne a neproteinogénne aminokyseliny, amíny, glukosinoláty, deriváty purínu, alkaloidy. Základný mechanizmus biosyntézy a význam týchto látok.

23. Metabolizmus síry. Príjam a asimilácia síry. Metabolizmus Cysteínu a metionínu. Glutatión. Sekundárne metabolity s obsahom síry.

24. Terpény. Syntéza terpénov a ich rozdelenie. Funkcie terpénov v rastlinách a v ekologických vzťahoch.

25. Fenolové látky. Metabolity cesty kyseliny šikimovej. Všeobecná fenylpropanoidová dráha. Kumaríny, ligníny. Polyketid syntázy a ich význam pre tvobu komplexnýxh fenolov (kurkumíny, flavonoidy a podobne). Význam jednotlivých podskupín fenolových látok.

26. Katabolické procesy v rastlinách, dýchanie. Rozklad rastlinných sacharidov. Glykolýza, Pentózový cyklus. transport medziproduktov do mitochondrií, Citrátový cyklus. Mitochondriálne dýchanie, význam kyslíka pre dýchanie, tvorba ATP.

27. Fotoreceptory rastlín. Fytochrómy. Chemická štruktúra, mechanizmus pôsobenia, fyziologické účinky. Fototropíny, kryptochrómy, receptory UV-svetla.

28. Rast rastlín, životný cyklus rastlín. Rastové hormóny, percepcia a vedenie hormonálneho signálu. Štruktúra a účinky auxínov, giberelínov, cytokinínov, brassinosteroidov. Tropizmy nastie.

29. Kvitnutie rastlín. Indukcia kvitnutia, fotoperiodizmus, vývin kvetných orgánov.

30. Stresové hormóny, ich význam a účinok (Kyselina abscisová, etylén, strigolaktóny, kys. jasmonová, salicylová a iné).

31. Typy abiotického stresu rastlín. Mechanizmy a odpovede rastlín na abiotický stres

32. Typy biotického stresu rastlín. Odpovede a ochrana rastlín pred biotickým stresom.