BIOCHÉMIA
Podmieňujúce: ÚCHV/BMB1/03 a ÚCHV/BCM/04 a ÚCHV/BFP/04/08
KLINICKÁ BIOCHÉMIA:
Prerekvizity: Podmieňujúce: ÚCHV/KLB1/03 a ÚCHV/PAT1/03 a ÚCHV/BMB1/03
Alternujúce: ÚCHV/KLB1/03 a ÚCHV/PAT1/03
BIOCHÉMIA:
1. Proteíny (rozdelenie podľa funkcie, uvedenie príkladov, peptidová väzba, polypeptidový reťazec, Ramachandranov graf).
2. Organizácia štruktúry proteínov (primárna, sekundárna, terciárna, kvartérna štruktúra, prvky sekundárnej štruktúry) a techniky na určenie proteínovej štruktúry a veľkosti proteínov.
3. Biosyntéza proteínov (aktivácia aminokyselín, iniciácia, elongácia, terminácia, translačné faktory).
4. Posttranslačné modifikácie proteínov (rozdelenie, význam, lokalizácia v bunke, uvedenie príkladov).
5. Biosyntéza proteínov na endoplazmatickom retikule (mechanizmus, signálna hypotéza, signálny peptid, triedenie proteínov, Golgiho aparát, KDEL sekvencia).
6. Translokácia proteínov cez membrány organel (endoplazmatické retikulum, mitochondria, chloroplast, jadro, úloha chaperónov).
7. Neribozomálna biosyntéza peptidov (mechanizmus, význam, multifunkčné enzýmové komplexy) a syntéza peptidov in vitro.
8. Fyzikálno-chemické metódy štúdia proteínov (optické metódy: UV-Vis spektrofotometria, fluorescenčná spektrofotometria, kruhový dichroizmus; separačné metódy: chromatografia, SDS-PAGE).
9. Membránové proteíny (rozdelenie, štruktúra, funkcie, spôsoby zabudovania do membrány a spôsoby interakcie s membránou).
10. Degradácia proteínov (proteázy, lyzozóm, ubiquitín, proteazóm, mechanizmus ubiquitinylácie).
11. Interakcia proteín-ligand. Langmuirova rovnica – algebraické a grafické vyjadrenie. Definícia rovnovážnej konštanty.
12. Michaelis-Mentenova rovnica – algebraické a grafické vyjadrenie. Definícia KM, kcat, kcat/KM.
13. Faktory ovplyvňujúce katalytickú reakciu.
14. Katalytické stratégie (kovalentná katalýza, acidobázická katalýza, katalýza aproximáciou, kovové ióny v katalýze).
15. Spôsoby regulácie katalýzy (alosterická kontrola, izoenzýmy, reverzibilná kovalentná modifikácia, proteolytická aktivácia).
16. Hemoglobín – príklad alosterickej modulácie.
17. Inhibícia enzýmov (reverezibilná a ireverzibilná inhibícia).
18. Organizácia genómu prokaryotických a eukaryotických buniek. Genetický kód.
19. Replikácia DNA, rozdiely replikačných mechanizmov v prokaryotických a eukaryotických bunkách a vírusoch. Katalytická funkcia DNA polymeráz, topoizomeráz.
20. Regulácia transkripcie kódujúcich a nekódujúcich oblastí DNA, postranskripčná modifikácia a editácia RNA, porovnanie transkripcie v prokaryotických a eukaryotických bunkách, RNA polymerázy a transkripčné faktory, promótory, štruktúra mRNA.
21. Základné mechanizmy proteosyntézy v bunkových systémoch, štruktúra a funkcia ribozómov a molekúl t-RNA.
22. Génové manipulácie, základy rekombinačných techník, využitie rôznych enzýmov a reverznej transkriptázy, editácia DNA.
23. Sekvenovanie nukleových kyselín.
24. Signálny systém buniek, receptory, sekundárny posol, význam G-proteínov.
25. Molekulová podstata karcinogenézy, mutagény, onkogény, tumor- supresorové gény.
KLINICKÁ BIOCHÉMIA:
1. Klinická biochémia – náplň, význam a prínos v liečebno-preventívnom procese.
2. Metabolizmus cukrov všeobecne - metabolizmus glukózy.
3. Metabolizmus tukov všeobecne - metabolizmus lipoproteínových častíc in vivo.
4. Metabolizmus bielkovín - všeobecne.
5. Metabolizmus nukleových kyselín.
6. Moč, tvorba moču za fyziologických podmienok. Vyšetrenie a vyhodnotenie vyšetrenia moču.
7. Gastrointestinálny trakt - vyšetrenie slín, žalúdočnej šťavy, duodenálnej šťavy a stolice.
8. GIT- pečeň, funkcia a vyšetrovacie prístupy - pankreas, funkcia a vyšetrovacie prístupy.
9. Metabolizmus svalov kostrových a srdcového, vyšetrovacie možnosti.
10. Metabolizmus kostí, vyšetrovacie možnosti.
11. Hormóny – rozdelenie, mechanizmus účinku, regulácie, hormóny hypotalamu a hypofýzy.
12. Hormóny štítnej žľazy a prištítnych teliesok. Hormóny drene a kôry nadobličiek.
13. Acidobázická rovnováha.
14. Patobiochémia: náplň, význam a prínos v liečebno-preventívnom procese.
15. Poruchy metabolizmu cukrov, diabetes melitus, diagnostika, vyšetrenie diabetika.
16. Poruchy metabolizmu lipoproteínov, vzťah k rozvoju arterosklerózy.
17. Poruchy metabolizmu aminokyselín a bielkovín.
18. Poruchy metabolizmu nukleových kyselín.
19. Moč, tvorba moču za patologických podmienok.
20. Vyšetrenie moču pri funkčných a organických ochoreniach obličiek.
21. Gastrointestinálny trakt.
22. GIT- pečeň, poruchy proteosyntézy, detoxikácie, vyšetrenie integrity hepatocytov, typy ikterov.
23. Poruchy metabolizmu svalov kostrových a srdcového, diagnostika akútneho infarktu myokardu.
24. Poruchy metabolizmu kostí, osteoporóza.
25.Hormóny hyper a hypopituitarizmy.
26. Poruchy acidobázickej rovnováhy.
BIOCHÉMIA:
1. Proteíny (rozdelenie podľa funkcie, uvedenie príkladov, peptidová väzba, polypeptidový reťazec, Ramachandranov graf).
2. Organizácia štruktúry proteínov (primárna, sekundárna, terciárna, kvartérna štruktúra, prvky sekundárnej štruktúry) a techniky na určenie proteínovej štruktúry a veľkosti proteínov.
3. Biosyntéza proteínov (aktivácia aminokyselín, iniciácia, elongácia, terminácia, translačné faktory).
4. Posttranslačné modifikácie proteínov (rozdelenie, význam, lokalizácia v bunke, uvedenie príkladov).
5. Biosyntéza proteínov na endoplazmatickom retikule (mechanizmus, signálna hypotéza, signálny peptid, triedenie proteínov, Golgiho aparát, KDEL sekvencia).
6. Translokácia proteínov cez membrány organel (endoplazmatické retikulum, mitochondria, chloroplast, jadro, úloha chaperónov).
7. Neribozomálna biosyntéza peptidov (mechanizmus, význam, multifunkčné enzýmové komplexy) a syntéza peptidov in vitro.
8. Fyzikálno-chemické metódy štúdia proteínov (optické metódy: UV-Vis spektrofotometria, fluorescenčná spektrofotometria, kruhový dichroizmus; separačné metódy: chromatografia, SDS-PAGE).
9. Membránové proteíny (rozdelenie, štruktúra, funkcie, spôsoby zabudovania do membrány a spôsoby interakcie s membránou).
10. Degradácia proteínov (proteázy, lyzozóm, ubiquitín, proteazóm, mechanizmus ubiquitinylácie).
11. Interakcia proteín-ligand. Langmuirova rovnica – algebraické a grafické vyjadrenie. Definícia rovnovážnej konštanty.
12. Michaelis-Mentenova rovnica – algebraické a grafické vyjadrenie. Definícia KM, kcat, kcat/KM.
13. Faktory ovplyvňujúce katalytickú reakciu.
14. Katalytické stratégie (kovalentná katalýza, acidobázická katalýza, katalýza aproximáciou, kovové ióny v katalýze).
15. Spôsoby regulácie katalýzy (alosterická kontrola, izoenzýmy, reverzibilná kovalentná modifikácia, proteolytická aktivácia).
16. Hemoglobín – príklad alosterickej modulácie.
17. Inhibícia enzýmov (reverezibilná a ireverzibilná inhibícia).
18. Organizácia genómu prokaryotických a eukaryotických buniek. Genetický kód.
19. Replikácia DNA, rozdiely replikačných mechanizmov v prokaryotických a eukaryotických bunkách a vírusoch. Katalytická funkcia DNA polymeráz, topoizomeráz.
20. Regulácia transkripcie kódujúcich a nekódujúcich oblastí DNA, postranskripčná modifikácia a editácia RNA, porovnanie transkripcie v prokaryotických a eukaryotických bunkách, RNA polymerázy a transkripčné faktory, promótory, štruktúra mRNA.
21. Základné mechanizmy proteosyntézy v bunkových systémoch, štruktúra a funkcia ribozómov a molekúl t-RNA.
22. Génové manipulácie, základy rekombinačných techník, využitie rôznych enzýmov a reverznej transkriptázy, editácia DNA.
23. Sekvenovanie nukleových kyselín.
24. Signálny systém buniek, receptory, sekundárny posol, význam G-proteínov.
25. Molekulová podstata karcinogenézy, mutagény, onkogény, tumor- supresorové gény.
KLINICKÁ BIOCHÉMIA:
1. Klinická biochémia – náplň, význam a prínos v liečebno-preventívnom procese.
2. Metabolizmus cukrov všeobecne - metabolizmus glukózy.
3. Metabolizmus tukov všeobecne - metabolizmus lipoproteínových častíc in vivo.
4. Metabolizmus bielkovín - všeobecne.
5. Metabolizmus nukleových kyselín.
6. Moč, tvorba moču za fyziologických podmienok. Vyšetrenie a vyhodnotenie vyšetrenia moču.
7. Gastrointestinálny trakt - vyšetrenie slín, žalúdočnej šťavy, duodenálnej šťavy a stolice.
8. GIT- pečeň, funkcia a vyšetrovacie prístupy - pankreas, funkcia a vyšetrovacie prístupy.
9. Metabolizmus svalov kostrových a srdcového, vyšetrovacie možnosti.
10. Metabolizmus kostí, vyšetrovacie možnosti.
11. Hormóny – rozdelenie, mechanizmus účinku, regulácie, hormóny hypotalamu a hypofýzy.
12. Hormóny štítnej žľazy a prištítnych teliesok. Hormóny drene a kôry nadobličiek.
13. Acidobázická rovnováha.
14. Patobiochémia: náplň, význam a prínos v liečebno-preventívnom procese.
15. Poruchy metabolizmu cukrov, diabetes melitus, diagnostika, vyšetrenie diabetika.
16. Poruchy metabolizmu lipoproteínov, vzťah k rozvoju arterosklerózy.
17. Poruchy metabolizmu aminokyselín a bielkovín.
18. Poruchy metabolizmu nukleových kyselín.
19. Moč, tvorba moču za patologických podmienok.
20. Vyšetrenie moču pri funkčných a organických ochoreniach obličiek.
21. Gastrointestinálny trakt.
22. GIT- pečeň, poruchy proteosyntézy, detoxikácie, vyšetrenie integrity hepatocytov, typy ikterov.
23. Poruchy metabolizmu svalov kostrových a srdcového, diagnostika akútneho infarktu myokardu.
24. Poruchy metabolizmu kostí, osteoporóza.
25.Hormóny hyper a hypopituitarizmy.
26. Poruchy acidobázickej rovnováhy.
Uvedená v schválenom zadaní diplomovej práce
Diplomová práca je výsledkom vlastnej tvorivej práce študenta. Nesmie vykazovať prvky akademického podvodu a musí spĺňať kritériá správnej výskumnej praxe definované v Rozhodnutí rektora č. 21/2021, ktorým sa stanovujú pravidlá posudzovania plagiátorstva na Univerzite Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach a jej súčastiach. Plnenie kritérií sa overuje najmä v procese školenia a v procese obhajoby práce. Ich nedodržanie je dôvodom na začatie disciplinárneho konania.
slovenský alebo anglický
Študent realizuje činnosti pod vedením vedúceho diplomovej práce. Výsledkom práce študenta má byť splnenie cieľov uvedených v schválenom zadaní diplomovej práce.
Diplomovou prácou študent preukáže zvládnutie rozšírenej teórie a odbornej terminológie študijného odboru, nadobudnutie vedomostí, zručností a kompetentností v súlade s deklarovaným profilom absolventa študijného programu, ako aj schopnosť aplikovať ich originálnym spôsobom pri riešení vybraného problému študijného odboru. Študent preukáže schopnosť samostatnej odbornej práce z obsahového, formálneho a etického hľadiska. Ďalšie podrobnosti diplomovej práce určuje Smernica č. 1 /2011 o základných náležitostiach záverečných prác a Študijný poriadok UPJŠ v Košiciach pre 1., 2. a spojený 1. a 2. stupeň.