DDizertačná prácaZENPh. D. thesisLF UPJŠUniverzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach, Lekárska fakulta2026/2027ENPavol Jozef Šafárik University in Košice Faculty of MedicineULCHBKBÚstav lekárskej a klinickej biochémie UPJŠ LFENDepartment of Medical and Clinical Biochemistry76609Fluorescenčná metabolomika – analýza telových tekutín novej generácie2026-03-04T00:00:00.000+01:0002Školiteľdoc. Ing. Katarína Dubayová, PhD.ENTutor1NázovENFluorescence metabolomics - analysis of body fluids of the new generation1NázovSKFluorescenčná metabolomika – analýza telových tekutín novej generácie2LiteratúraSKMcPherson R.A., Pincus M.R.: Henry´s Clinical Diagnosis and Management by Laboratory Methods, 2011, Elsevier Hunter B.D.: Molecular Genetics and Personalized Medicine, 2014, Humana Press Inc. Fang J.: Statistical Methods for Biomedical Research, 2021, World Scientific Pob Co Pte Lakowicz, J.: Principles of Fluorescence Spectroscopy, 2006, 3rd edition, Springer Vedecké a odborné publikácie z uvedenej oblasti evidované v databázach napr. Web of Science, Scopus, PubMed Scientific and professional publications in the field registered in databases, e.g. Web of Science, Scopus, PubMed3CieľSKŠtúdium zmien fluorescenčného metabolómu krvi a moču pomocou fluorescenčnej profilovej analýzy u pacientov s vybranými závažnými ochoreniami (napr. karcinómy endometria). Paralelne metódami molekulovej analýzy (napr. PCR, ncRNA) detegovať a monitorovať abnormality. Zmeny transkriptómu sa môžu prejaviť na úrovni metabolómu telovej tekutiny.3CieľENStudy of changes in the fluorescent metabolome of blood and urine using fluorescent profile analysis in patients with selected serious diseases (e.g. endometrial carcinomas). In parallel, detect and monitor abnormalities using molecular analysis methods (e.g. PCR, ncRNA). Changes in the transcriptome can be reflected at the level of the body fluid metabolome.6Kľúčové slováENfluorescence profiling analysis, pCR, ncRNA, body fluids, cancer6Kľúčové slováSKfluorescenčná profilová analýza, PCR, ncRNA, telové tekutiny, nádory45.všeobecné lekárstvoKBdklinická biochémiaENGeneral MedicineClinical Biochemistry76643Možnosti laboratórnej detekcie zvýšeného kardiometabolického rizika v pediatrickej populácii2026-03-09T00:00:00.000+01:0002Školiteľdoc. Ing. Katarína Dubayová, PhD.ENTutor3KonzultantMUDr. Renáta Lenártová, PhD.ENConsultant1NázovENPossibilities for laboratory detection of increased cardiometabolic risk in the pediatric1NázovSKMožnosti laboratórnej detekcie zvýšeného kardiometabolického rizika v pediatrickej populácii2LiteratúraSKMcPherson R.A., Pincus M.R.: Henry´s Clinical Diagnosis and Management by Laboratory Methods, 2011, Elsevier Hunter B.D.: Molecular Genetics and Personalized Medicine, 2014, Humana Press Inc. Fang J.: Statistical Methods for Biomedical Research, 2021, World Scientific Pob Co Pte Lakowicz, J.: Principles of Fluorescence Spectroscopy, 2006, 3rd edition, Springer Vedecké a odborné publikácie z uvedenej oblasti evidované v databázach napr. Web of Science, Scopus, PubMed Scientific and professional publications in the field registered in databases, e.g. Web of Science, Scopus, PubMed3CieľSKKomplexné zhodnotenie vybraných laboratórnych parametrov a ich štúdium vo vzťahu k inzulínovej rezistencii (HOMA-IR) a zápálovej aktivite (hsCRP). Pandémia obezity už aj v detskej populácii si vyžiadala aj monitoring laboratórnych parametrov, ktoré boli typické pre dospelú a staršiu populáciu. Štandardne analyzované parametre súvisiace s procesom aterogenézy (celkový cholesteról, HDL a LDL cholesteról, Lp a iné lipoproteínové subfrakcie) budú doplnené o špeciálnu fluorescenčnú metabolomickú analýzu krvi a moču. Kombinácia klasických laboratórnych testov a fluorescenčnej profilovej analýzy môže rozšíriť diapazón hodnotiaceho kritéria aterogenézy.3CieľENComprehensive evaluation of selected laboratory parameters and their study in relation to insulin resistance (HOMA-IR) and inflammatory activity (hsCRP). The obesity pandemic, even in the pediatric population, also required monitoring of laboratory parameters typical of the adult and elderly populations. Standardly analysed parameters associated with atherogenesis (total cholesterol, HDL, and LDL cholesterol, Lp, and other lipoprotein subfractions) will be supplemented with a specialized fluorescence metabolomic analysis of blood and urine. The combination of classical laboratory tests and fluorescence profile analysis can expand the range of criteria for assessing atherogenesis.6Kľúčové slováENbiomarkers (e.g. hsCRP, HDL-Ch, LDL-Ch), fluorescence profile analysis6Kľúčové slováSKbiomarkery (napr. hsCRP, HDL-Ch, LDL-Ch), fluorescenčná profilová analýza45.všeobecné lekárstvoKBdeklinická biochémiaENGeneral MedicineClinical Biochemistry76641Nové prístupy sledovania regenerácie poškodených buniek2026-03-09T00:00:00.000+01:0002Školiteľprof. RNDr. Vladimíra Tomečková, PhD.ENTutor3KonzultantIng. Denisa Harvanová, PhD.ENConsultant1NázovENNew approaches for monitoring the regeneration of damaged cells1NázovSKNové prístupy sledovania regenerácie poškodených buniek2LiteratúraSKDi Talia S, Poss KD. Monitoring Tissue Regeneration at Single-Cell Resolution. Cell Stem Cell. 2016 Oct 6;19(4):428-431. doi: 10.1016/j.stem.2016.09.007. Nelson TJ, Behfar A, Terzic A. Strategies for therapeutic repair: The "R(3)" regenerative medicine paradigm. Clin Transl Sci. 2008 Sep;1(2):168-171. doi: 10.1111/j.1752-8062.2008.00039.x. PMID: 19756244; PMCID: PMC2743025. Vedecké a odborné publikácie z uvedenej oblasti evidované v databázach napr. Web of Science, Scopus, PubMed Scientific and professional publications in the field registered in databases, e.g. Web of Science, Scopus, PubMed3CieľSKŠtudovať príčiny vzniku ochorení a ich regenerácie pomocou rôznych terapeutických prístupov. Študovať prirodzené samoobnovenie štruktúry buniek a ich funkcie. Cieľom je zabezpečiť implementáciu nových terapeutických stratégií personalizovanej reparácie a algoritmov manažmentu chorôb, čo bude vyžadovať multidisciplinárnu spoluprácu. 3CieľENStudy of the causes of diseases and their regeneration using various therapeutic approaches. Studying the natural self-renewal of cell structure and function. The goal is to ensure the implementation of new therapeutic strategies and personalized repair and disease management algorithms that use multidisciplinary collaboration.6Kľúčové slováENregeneration, damaged cells, monitoring, therapy6Kľúčové slováSKregenerácia, poškodené bunky, monitorovanie, terapia45.všeobecné lekárstvoKBdklinická biochémiaENGeneral MedicineClinical Biochemistry76611Sledovanie vybraných biomarkerov močových biomarkerov pri nefrotickom syndróme2026-03-04T00:00:00.000+01:0003Konzultantdoc. MUDr. Anna Birková, PhD.ENConsultant2Školiteľprof. Ing. Mária Mareková, CSc.ENTutor1NázovENMonitoring selected urinary biomarkers in nephrotic syndrome1NázovSKSledovanie vybraných biomarkerov močových biomarkerov pri nefrotickom syndróme2LiteratúraSKZhu S, Zhang J, Gao L, Ye Q, Mao J. The Pathogenesis of Nephrotic Syndrome: A Perspective from B Cells. Kidney Dis (Basel). 2024 Aug 29;10(6):531-544. doi: 10.1159/000540511. PMID: 39664337; PMCID: PMC11631018. Tapia C, Bashir K. Nephrotic Syndrome. [Updated 2023 May 29]. In: StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2025 Jan-. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK470444/ Tapia C, Bashir K. Nephrotic Syndrome. [Updated 2023 May 29]. In: StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2025 Jan-. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK470444/ Frățilă, V.-G.; Lupușoru, G.; Sorohan, B.M.; Obrișcă, B.; Mocanu, V.; Lupușoru, M.; Ismail, G. Nephrotic Syndrome: From Pathophysiology to Novel Therapeutic Approaches. Biomedicines 2024, 12, 569. https://doi.org/10.3390/biomedicines12030569 Shin JI, Kronbichler A, Oh J, Meijers B. Nephrotic Syndrome: Genetics, Mechanism, and Therapies. Biomed Res Int. 2018 Jan 28;2018:6215946. doi: 10.1155/2018/6215946. PMID: 29670902; PMCID: PMC5833294.3CieľSKNefrotický syndróm predstavuje klinický syndróm, ktorý vzniká v dôsledku poškodenia glomerulárnej filtračnej bariéry a je charakterizovaný masívnou proteinúriou, hypoalbuminémiou, edémami a hyperlipidémiou. Etiopatogenéza nefrotického syndrómu je komplexná a heterogénna a napriek významnému pokroku v poznaní molekulárnych a imunologických mechanizmov nie je v plnom rozsahu objasnená. Pri viacerých primárnych glomerulopatiách zostáva presný kauzálny mechanizmus vzniku poškodenia glomerulárnej filtračnej bariéry nejasný, čo limituje možnosti presnej diagnostiky, prognostickej stratifikácie a individualizácie liečby. Z tohto dôvodu je aktuálnym predmetom výskumu identifikácia nových, citlivých a špecifických biomarkerov v moči, ktoré by mohli odrážať aktivitu ochorenia, rozsah glomerulárneho a tubulointersticiálneho poškodenia a potenciálne prispieť k lepšiemu porozumeniu patogenézy nefrotického syndrómu.3CieľENNephrotic syndrome is a clinical condition that arises as a consequence of damage to the glomerular filtration barrier and is characterized by massive proteinuria, hypoalbuminemia, edema, and hyperlipidemia. The etiopathogenesis of nephrotic syndrome is complex and heterogeneous, and despite significant advances in understanding molecular and immunological mechanisms, it remains incompletely elucidated. In several primary glomerulopathies, the precise mechanism underlying damage to the glomerular filtration barrier remains unclear, which limits the ability to accurately diagnose, stratify prognosis, and individualize treatment. For this reason, the identification of novel, sensitive, and specific urinary biomarkers has become a current focus of research, as these biomarkers may reflect disease activity, the extent of glomerular and tubulointerstitial injury, and potentially contribute to a better understanding of the pathogenesis of nephrotic syndrome.6Kľúčové slováENnephropathy, nephrotic syndrome, urine, biomarker6Kľúčové slováSKnefropatia, nefrotický syndróm, moč, biomarker45.všeobecné lekárstvoKBdklinická biochémiaENGeneral MedicineClinical Biochemistry76642Štúdium a analýza metód stanovenia LDL-cholesterolu využitím najnovších metód u pacientov s vybranými ochoreniami2026-03-09T00:00:00.000+01:0002Školiteľprof. Ing. Mária Mareková, CSc.ENTutor3KonzultantMUDr. Renáta Lenártová, PhD.ENConsultant1NázovENStudy and analysis of methods for determining LDL-cholesterol using the latest methods in patients with selected diseases1NázovSKŠtúdium a analýza metód stanovenia LDL-cholesterolu využitím najnovších metód u pacientov s vybranými ochoreniami2LiteratúraSKMcPherson R.A., Pincus M.R.: Henry´s Clinical Diagnosis and Management by Laboratory Methods, 2011, Elsevier Hunter B.D.: Molecular Genetics and Personalized Medicine, 2014, Humana Press Inc. Fang J.: Statistical Methods for Biomedical Research, 2021, World Scientific Pob Co Pte Vedecké a odborné publikácie z uvedenej oblasti evidované v databázach napr. Web of Science, Scopus, PubMed Scientific and professional publications in the field registered in databases, e.g. Web of Science, Scopus, PubMed3CieľSKLipidové parametre, cielené na metabolizmus LDL lipoproteínov vrátane analýzy subfrakcií detegovaných metódou Lipoprint, budú študované vo vzťahu k vybraným ochoreniam pacientov. Súčasťou témy je aj porovnanie výsledkov LDL-cholesterolu získaných výpočtom aplikáciou empirických vzťahov (napr. podľa Friedewalda, podľa Martin-Hopkinsa, podľa Sampsonovej rovnice) a stanovených priamo meraním LDL-cholesterolu homogénnou metódo. Získané výsledky budú posudzované s ohľadom na ich diagnostickú výpovednú hodnotu vo vzťahu k vybraným ochoreniam.3CieľENLipid parameters, aimed at LDL lipoprotein metabolism, including the analysis of subfractions detected by the Lipoprint method, will be studied in relation to selected diseases of patients. The topic also includes a comparison of LDL-cholesterol results obtained by calculation using empirical relationships (e.g., according to Friedewald, Martin-Hopkins, or the Sampson equation) and those determined directly by measuring LDL-cholesterol using a homogeneous method. The obtained results will be assessed for their diagnostic value in relation to selected diseases.6Kľúčové slováENdetermination of HDL-Ch, LDL-Ch, lipid parameters, other relevant biomarkers6Kľúčové slováSKstanovenie HDL-Ch, LDL-Ch, lipidové parametre, ďalšie relevantné biomarkery45.všeobecné lekárstvoKBdeklinická biochémiaENGeneral MedicineClinical Biochemistry76618Štúdium molekulových a environmentálnych determinantov reprodukčného zdravia v slovenskej populácii2026-03-05T00:00:00.000+01:0002Školiteľprof. RNDr. Miroslava Rabajdová, PhD.ENTutor1NázovENStudy of molecular and environmental determinants of reproductive health in the Slovak population1NázovSKŠtúdium molekulových a environmentálnych determinantov reprodukčného zdravia v slovenskej populácii2LiteratúraSK1. Wieczorek, K., Szczęsna, D., Radwan, M. et al. Exposure to air pollution and ovarian reserve parameters. Sci Rep 14, 461 (2024). https://doi.org/10.1038/s41598-023-50753-6 2. Sun, J., Geng, L., Zhou, D., Teng, X., Chen, M. et al. Gut microbiota participates in polystyrene microplastics-induced defective implantation through impairing uterine receptivity. J. Environ. Manag. 380, 124997 (2025). https://doi.org/10.1016/j.jenvman.2025.124997 3. Fang J.: Statistical Methods for Biomedical Research, 2021, World Scientific Pob Co Pte 4. Vedecké a odborné publikácie z uvedenej oblasti evidované v databázach napr. Web of Science, Scopus, PubMed3CieľSKCieľom dizertačnej práce je charakterizovať molekulové a environmentálne determinanty reprodukčného zdravia v slovenskej populácii prostredníctvom integrácie klinických, demografických a omických dát, s cieľom identifikovať biologické mechanizmy, biomarkery a rizikové faktory asociované s poruchami fertility.6Kľúčové slováENx6Kľúčové slováSKreprodukčné zdravie, neplodnosť, biomarkery, environmentálne faktory45.všeobecné lekárstvoKBdklinická biochémiaENGeneral MedicineClinical Biochemistry