DDizertačná prácaZENPh. D. thesisLF UPJŠUniverzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach, Lekárska fakulta2026/2027ENPavol Jozef Šafárik University in Košice Faculty of MedicineULMÚstav lekárskej a klinickej mikrobiológie UPJŠ LF a UNLPENDepartment of Medical and Clinical Microbiology76621Epidemiologická a mikrobiologická analýza výskytu baktérií z radu Enterobacterales s produkciou karbapenemáz v Univerzitnej nemocnici L. Pasteura v Košiciach2026-03-05T00:00:00.000+01:0002Školiteľdoc. RNDr. Katarína Čurová, PhD.ENTutor1NázovENEpidemiological and mikrobiological analysis of the occurence of bacteria from the Enterobacterales order with carbapenemase production in the L. Pasteur University Hospital in Košice1NázovSKEpidemiologická a mikrobiologická analýza výskytu baktérií z radu Enterobacterales s produkciou karbapenemáz v Univerzitnej nemocnici L. Pasteura v Košiciach2LiteratúraSKLane CR, Brett J, Schultz M, et al. Search and Contain: Impact of an Integrated Genomic and Epidemiological Surveillance and Response Program for Control of Carbapenemase-producing Enterobacterales. Clin Infect Dis. 2021 Dec 6;73(11):e3912-e3920. doi: 10.1093/cid/ciaa972. PMID: 32663248; PMCID: PMC8662772. Marimuthu, K., Venkatachalam, I., Koh, V. et al. Whole genome sequencing reveals hidden transmission of carbapenemase-producing Enterobacterales. Nat Commun 13, 3052 (2022). https://doi.org/10.1038/s41467-022-30637-5 Lee AS, Dolan L, Jenkins F, Crawford B, van Hal SJ. Active surveillance of carbapenemase-producing Enterobacterales using genomic sequencing for hospital-based infection control interventions. Infect Control Hosp Epidemiol. 2024 Feb;45(2):137-143. doi: 10.1017/ice.2023.205. Epub 2023 Sep 13. PMID: 37702063; PMCID: PMC10877539. Hadjirin NF, van Tonder AJ, Blane B, et al. Dissemination of carbapenemase-producing Enterobacterales in Ireland from 2012 to 2017: a retrospective genomic surveillance study. Microb Genom. 2023 Mar;9(3):mgen000924. doi: 10.1099/mgen.0.000924. PMID: 36916881; PMCID: PMC10132065. 2LiteratúraENLane CR, Brett J, Schultz M, et al. Search and Contain: Impact of an Integrated Genomic and Epidemiological Surveillance and Response Program for Control of Carbapenemase-producing Enterobacterales. Clin Infect Dis. 2021 Dec 6;73(11):e3912-e3920. doi: 10.1093/cid/ciaa972. PMID: 32663248; PMCID: PMC8662772. Marimuthu, K., Venkatachalam, I., Koh, V. et al. Whole genome sequencing reveals hidden transmission of carbapenemase-producing Enterobacterales. Nat Commun 13, 3052 (2022). https://doi.org/10.1038/s41467-022-30637-5 Lee AS, Dolan L, Jenkins F, Crawford B, van Hal SJ. Active surveillance of carbapenemase-producing Enterobacterales using genomic sequencing for hospital-based infection control interventions. Infect Control Hosp Epidemiol. 2024 Feb;45(2):137-143. doi: 10.1017/ice.2023.205. Epub 2023 Sep 13. PMID: 37702063; PMCID: PMC10877539. Hadjirin NF, van Tonder AJ, Blane B, et al. Dissemination of carbapenemase-producing Enterobacterales in Ireland from 2012 to 2017: a retrospective genomic surveillance study. Microb Genom. 2023 Mar;9(3):mgen000924. doi: 10.1099/mgen.0.000924. PMID: 36916881; PMCID: PMC10132065. 3CieľSK1. Dôkaz produkcie karbapenemáz u baktérií z radu Enterobacterales z klinických materiálov pacientov hospitalizovaných v UNLP Košice na fenotypovej a genotypovej úrovni 2. Typizovanie izolátov s produkciou karbapenemáz pomocou infračervenej spektroskopie 3. Molekulárna analýza génov rezistencie pomocou celogenómového sekvenovania vybraných klinických izolátov, identifikácia úspešných sekvenčných typov CPE. 4. Epidemiologická analýza výskytu CPE a možného horizontálneho prenosu medzi pacientami hospitalizovanými na jednotlivých klinikách/oddeleniach a v rámci presunu pacientov medzi jednotlivými klinikami a/alebo oddeleniami UNLP Košice4AnotáciaSKBaktérie z radu Enterobacterales sú najčastejším pôvodcom nozokomiálnych infekcií. Za poslednú dekádu je celosvetovo zaznamenaný enormný nárast výskytu multirezistentných baktérií, ktorý je spôsobený rozšírením enterobaktérií s produkciou karbapenemáz (CPE). Karbapenemázy sú enzýmy, ktoré sa vyznačujú schopnosťou hydrolyzovať široké spektrum antibiotík, vrátane karbapenémov. Účinnosť nových klinických preparátov zavisí od mechanizmu rezistencie na karbapenémy, resp. od typu produkovanej karbapenemázy. Pre ďalší manažment antibiotickej terapie je preto rozhodujúce presné a rýchle zistenie mechanizmu rezistencie na karbapenémy, resp. presná identifikácia typu produkovanej karbapenemázy. Jedným z potenciálnych zdrojov CPE je gastrointestinálny trakt pacientov, u ktorých sa môže vyskytovať bezpríznakové nosičstvo. Pre prípravu stratégií zameraných na zníženie výskytu nozokomiálnych infekcií je potrebné porozumieť spôsobu prenosu CPE v nemocničnom prostredí. Štandardné postupy pre prevenciu a kontrolu šírenia nozokomiálnych infekcií zdôrazňujú prevenciu priameho prenosu medzi pacientmi, s nutnosťou izolácie, resp. kohortizácie nosičov CPE ako kľúčovou zložkou v boji s nozokomiálnymi infekciami spôsobenými CPE. 6Kľúčové slováENEnterobacterales, carbapenemase, resistance, nozocomial infections, WGS, Biotyper IR6Kľúčové slováSKEnterobacterales, karbapenemáza, rezistencia, nozokomiálne infekcie, WGS, Biotyper IR45.všeobecné lekárstvoEPIDdepidemiológiaENGeneral MedicineEpidemiology